Содержание
Как выглядит ДНК человека: фото под микроскопом
Как выглядит ДНК человека: фото под микроскопом
string(4) «BLOG»
#Генетика
30 Мая 2019
Время чтения: 3 Минуты
Как выглядит ДНК? Общеизвестное представление дезоксирибонуклеиновой кислоты, как двух нитей закрученных в спираль, известно с 1953 года. НО, были открыты и другие формы этой молекулы:
- А-форма — считается, что это исключительно лабораторная форма, поскольку она образуется только при недостатке влаги. В отличии от классической В-формы, хромосома немного изогнута.
- Б-форма – классическое изображение хромосомы и двойной спирали ДНК внутри неё.
- Z-форма – самая необычная из всех форма. Если все прочие формы имеют спираль ДНК закрученную вправо, то в этой форме она закручена влево. И сама спираль больше зигзагообразная, чем спиральная.
Фото ДНК и ее структуры
Как выглядит молекула ДНК? Открытие молекулы дезоксирибонуклеиновой кислоты было совершено швейцарским биологом Фридрихом Мишером в 1869 году. На тот момент об этой молекуле не было известно ничего: ни ее строение, ни биологические функции.
То, что дезоксирибонуклеиновая кислота является носителем информации о развитии и работе всего организма стало известно только в 1944. В 1953 году ученые использовали рентгеновские лучи для облучения молекулы и по данным, составленным по отраженным молекулой лучам, составили первую схему ее строения.
ДНК под микроскопом
Под обычным микроскопом ДНК не рассмотреть: они подходят для изучения клеток, вирусов, состава крови и т.д. А электронным микроскопам нашего времени не хватает чувствительности, что бы показать детали строения нитей дезоксирибонуклеиновой кислоты. Так же современные цифровые микроскопы просвечивают образец потоком электронов, и этот поток слишком силен, он может повредить цепочки молекулы наследственности или вовсе их разорвать. Но это ограничение будет преодолено уже в ближайшее время, что позволит более детально изучить строение молекулы наследственности и ее взаимодействие с РНК.
Как впервые сфотографировали ДНК
Первую фотографию ДНК человека смогли сделать лишь в 2012 году. Современные сверхмощные цифровые микроскопы позволяют сделать снимок столь небольшого объекта, но имеют и заметные недостатки – из-за сильного облучения электронами нити дезоксирибонуклеиновой кислоты разрушаются, и получить более детальную картинку пока не представляется возможным. Но в общих деталях на снимках уже хорошо видно, как выглядит цепь ДНК.
Фотография дезоксирибонуклеиновой кислоты и нанотехнологии
Первые попытки сделать фото ДНК не оказались напрасными, и дали толчок развитию новой методике изучения структуры цепочки наследственности. На основе первой «положки» для фотографирования ДНК был изобретен наносенсор. А ученные из Иллинойса изобрели наноконденсатор, через который можно пропускать молекулу ДНК и определять ее структуру.
Факты из истории
В истории изучения дезоксирибонуклеиновой кислоты если несколько интересных фактов, некоторые из которых могут в бедующем раскрыть весь генетический потенциал человека, и в корне изменить нашу жизнь:
- В генах человека заложена способность к самоизлечению и самоомоложению. Что будет, когда наука откроет эти механизмы?
- Пока наука имеет представление о том, как работает 3% всей структуры молекулы наследственности и в них уже входит почти все о здоровье, питании и наследственных болезнях.
- С изучением дезоксирибонуклеиновой кислоты ученые пришли к выводу, что потенциально человек может жить до тысячи лет.
- В штате Мэриленд, США, булл проведен интересный ряд анализов. Один из тестов на биологическое родство показал, что у некой американки все её три дочери ей не родные. Женщина была беременна четвертым ребенком, но, когда он родился, тест показал, что и этот ребенок женщине не родной! Как такое может быть? Может слухи о телегонии и мифичны, но этот случай показал, что женщину могут одновременно оплодотворить двое мужчин, что и привело к таким странным результатам тестов.
Поделиться:
ДНК-тест может решить 10 главных задач здоровья.
Интересно? Проконсультируем бесплатно!
Я ознакомлен с Политикой в отношении обработки персональных данных клиентов MyGenetics, даю согласие на сбор, обработку и хранение моих персональных данных согласно форме.
Смотрите также
07/11/2020
ГМО: наши друзья или зло?
В наши дни три страшные буквы «ГМО» стали синонимом чего-то ужасного, а надпись «Без ГМО» считается гарантом качества. Но так ли это в действительности?
14/11/2018
Генетика поможет предсказать предрасположенность к алкоголизму
Причины алкоголизма многогранны. Часто он носит семейный характер, так же как и психические заболевания: маниакально-депрессивный психоз, депрессия, шизофрения. Но большую роль в этом может играть и генетика.
27/02/2020
«Лишний вес – признак того, что в организме есть поломка»
Ведущий врач-диетолог Нур-Султана Сания Ислямова уже 2 года сотрудничает с MyGenetics. Мы поговорили с ней, чтобы узнать, как генетические тесты помогают ей делать жизнь людей лучше каждый день.
03/07/2021
ПЦР диагностика: что это такое
Что такое «ПЦР», насколько эта методика эффективна и стоит ли доверять её результатам? Где, и в каких случая она применяется? Поговорим о тестах, ставших повседневными, и о тестах не столь известных. А так же, что показывает ПЦР, далее в этой статье.
Предыдущая
Следующая
какие инструменты помогают трансформировать жизнь — T&P
Все мы не раз видели эту картину: тонкая игла под микроскопом входит в полупрозрачную живую клетку, чтобы перенести туда ДНК. Но какие приборы нужны для того, чтобы сделать это? «Теории и практики» составили список самых интересных устройств, с помощью которых генетики проводят искусственное оплодотворение, создают генномодифицированные растения и определяют родство.
Электронный микроскоп: возможность видеть молекулы
Электронный микроскоп отличается от привычного нам оптического почти так же сильно, как компьютер отличается от печатной машинки. В этом приборе не используется свет: иначе говоря, мы никогда не сможем увидеть ДНК под ним в полном смысле этого слова. Размеры и форму объектов можно определить благодаря потоку электронов, которыми «обстреливают» молекулярные структуры. Частицы ударяются о свою мишень, отскакивают в разные стороны, и по траектории их полета ученые могут составить изображение того, что находится под электронным микроскопом.
Мы пока неспособны сфотографировать отдельную молекулу ДНК — знаменитую двойную спираль с двумя палочками сахаро-фосфатных стержней и миниатюрными перемычками — нуклеотидами. Для наблюдения за таким хрупким объектом наши электронные микроскопы слишком грубы, и потоки частиц неизменно успевают разбить структуру раньше, чем будет составлено ее изображение. Однако в начале 2012 года группе ученых из Генуи удалось запечатлеть «веревочку» ДНК, составленную из шести молекул, обернутых вокруг еще одной, седьмой. Для этого им пришлось создать абсолютно новую подложку с микроскопическими опорами, на которых ДНК была натянута, как телеграфный провод на столбах.
Микропипетка: перенос ДНК
Современные микропипетки — это высокоточные инструменты, способные дозировать крошечные объемы жидкости: от 1 до 1000 микролитров. Их можно найти в любой лаборатории или исследовательском центре, где проводится ПЦР-диагностика или другие генетические исследования.
Внешне микропипетки одновременно напоминают шприцы и шариковые ручки. В отличие от обыкновенной пипетки с мягким резиновым колпачком, микропипетка обладает крошечным тонким поршнем. Специалист просто нажимает на него большим пальцем, как на кнопку, поршень входит в узкий стеклянный капилляр, вытесняя из него воздух или жидкость. У микропипеток часто есть цветовая маркировка, чтобы можно было различить устройства разного объема. Также встречаются микропипетки с несколькими капиллярами — так называемыми «многоканальными модулями». Такие устройства позволяют забирать одинаковый объем жидкости сразу из нескольких пробирок или контейнеров.
Микроманипулятор: искусственное оплодотворение
Микроманипулятор — это прибор, позволяющий осуществлять тонкие и точные движения микроинструментов. С его помощью можно удалить или перенести клеточное ядро, сделать инъекцию в цитоплазму и др. Без приборов, руками эти действия выполнить невозможно: слишком мало давление, которое можно приложить к крошечному клочку материи. Вот почему все нужно делать с помощью джойстика и механизма, снижающего силу движения человеческих пальцев.
Микроманипулятор состоит из системы штативов с винтами, которые зажимают микроинструменты и обеспечивают их движение во всех направлениях. Также для работы необходима влажная масляная камера. Слой масла нужен, чтобы удержать клетку на месте и предохранить ее от высыхания.
Именно с помощью микроманипулятора специалисты проводят искусственное оплодотворение. Также прибор незаменим в генетических исследованиях: все инъекции растворов, в том числе, внесение в одиночную клетку новой ДНК in vitro, осуществляются с использованием микроманипулятора.
Биолистическая пушка: трансформация растений
Биолистическая пушка — один из самых распространенных инструментов генной инженерии растений (особенно однодольных: пшеницы, ячменя, кукурузы и др. ). Она стреляет частицами вольфрама, на которые перед работой напыляют ДНК. Специалисты наносят эти «генетические пули» на целлофановую подложку и помещают в пушку. Под «стволом», на расстоянии 10-15 см, устанавливают чашку с растительной тканью, или каллусом — клетками, которые позже можно будет культивировать. После этого происходит выстрел. Вакуумный насос резко уменьшает давление в «стволе», и пушка на огромной скорости выбрасывает вольфрамовые частички. Они разрывают стенки клеток, без труда входят в цитоплазму и ядра клеток и доставляют туда ДНК. Из-за силы бомбардировки ткань по центру чашки, как правило, погибает. Однако по периметру клетки остаются живы и хорошо протрансформированы. Их и культивируют в дальнейшем, чтобы получить трансгенный сорт растения.
Электропоратор: трансформация животных
Электропоратор — еще один прибор для трансформации клеток живых существ: от бактерий и дрожжей до млекопитающих, а также растений. Перед работой раствор с живыми клетками и дополнительными молекулами ДНК помещают в пластиковые кюветы с алюминиевыми электродами. Затем электропоратор с помощью электрического поля создает в мембранах клеток крошечные поры, сквозь которые генетические конструкции проникают в цитоплазму. После завершения процесса поры закрываются, и клетки остаются целы и невредимы.
Сегодня электропорация считается самым простым и эффективным методом введения молекул ДНК в клетки. До недавнего времени он, впрочем, использовался не так часто из-за отсутствия серийного производства электропораторов.
Амплификатор: ПЦР
Амплификатор можно найти практически в любом медицинском центре, где проводятся генетические исследования. Он и позволяет проводить полимеразную цепную реакцию (ПЦР), после которой специалисты уже с помощью другого прибора находят, идентифицируют и подсчитывают различные фрагменты ДНК. Амплификаторы применяются при проведении клинических анализов и судмедэкспертизы, в ходе научных исследований, а также для экологического и санитарного контроля.
Метод ПЦР (полимеразной цепной реакции) основан на поиске и многократном копировании определенных участков ДНК, которые соответствуют заданным критериям. Для этого используется особый фермент — полимераза. Весь процесс протекает in vitro.
В ходе ПЦР специалисты нагревают и охлаждают пробирки с образцами, полимеразой и праймерами — короткими фрагментами нуклеиновой кислоты, комплементарными ДНК- или РНК-мишени. Мишенями всегда являются одиночные нити ДНК, к которым в определенном месте должен присоединиться праймер.
Процесс начинается с того, что температуру в пробирках повышают до 94-98°С. В этот момент водородные связи в двойных спиралях распадаются, и все одиночные цепочки оказываются сами по себе. Затем пробирки начинают охлаждать, чтобы праймеры с помощью новых водородных связей могли связаться со своими мишенями и образовать молекулы. Ну, а после этого, на финальной стадии, в дело вступает фермент, который на основе получившихся структур синтезирует множество дочерних ДНК — точных копий родительской молекулы. Они и нужны специалистам, чтобы провести анализ.
Анализатор нуклеиновых кислот: диагностика и судмедэкспертиза
Анализатор нуклеиновых кислот, или АНК, — второй необходимый для ПЦР-диагностики прибор. Когда реакция завершается, в это устройство переносят «переживший» полимеразную цепную реакцию образец. Ученые с помощью АНК подсчитывают, сколько искомых молекул возникло в пробирке, а также оценивают их качества.
Сегодня существуют анализаторы нуклеиновых кислот, которые работают в режиме реального времени. При наличии такого прибора амплификатор специалистам не нужен: весь процесс, от стадии нагревания пробирок до подсчета молекул прибор выполняет сам.
Секвенатор: исследования генома
Секвенирование — это процесс определения последовательности нуклеотидов в молекулах ДНК. Именно оно позволяет нам читать геномы и исследовать их. Правда, сегодня не существует ни одного метода, который работал бы для всей молекулы целиком. Чтобы определить, как расположены нуклеотиды в ниточке ДНК, специалистам всегда приходится сначала разделить ее на множество небольших участков. Затем ученые проводят ПЦР: нагревают и охлаждают эти «генетические кусочки» в пробирках с праймерами и ферментом. В результате появляется множество копий искомого участка ДНК. Секвенатор может прочитать каждую из них.
Узнать больше
Микроскопы для ДНК | Nikon
Отобразить:
Nikon ECLIPSE Ni
Прямой микроскоп
Быстрый просмотр Подробное описание
Прямой исследовательский микроскоп Nikon Eclipse Ni
Микроскопы серии ECLIPSE Ni отличаются широкими возможностями визуализации. Микроскоп Ni является надежной основой биологических исследований, предлагая гибкость системы при выборе конфигурации и возможностей автоматизации.
Запросить цену
Подробное описание
Nikon ECLIPSE Ni
Микроскопы серии ECLIPSE Ni отличаются широкими возможностями визуализации. Микроскоп Ni является надежной основой биологических исследований, предлагая гибкость системы при выборе конфигурации и возможностей автоматизации.
Свяжитесь со специалистом удобным для Вас способом:
(495) 223-40-00 | [email protected]
Запросить цену
Подробное описание
Nikon Eclipse Ti2
НОВИНКА
Инвертированный микроскоп
Быстрый просмотр Подробное описание
Инвертированный исследовательский микроскоп Nikon ECLIPSE Ti2
Eclipse Ti2 обеспечивает уникальное поле зрения 25 мм. При таком большом поле зрения в Ti2 максимально увеличена площадь матрицы крупноформатных CMOS камер без какого-либо ухудшения качества, а также существенно повышена производительность
Запросить цену
Подробное описание
Nikon Eclipse Ti2
Eclipse Ti2 обеспечивает уникальное поле зрения 25 мм. При таком большом поле зрения в Ti2 максимально увеличена площадь матрицы крупноформатных CMOS камер без какого-либо ухудшения качества, а также существенно повышена производительность
Свяжитесь со специалистом удобным для Вас способом:
(495) 223-40-00 | [email protected]
Запросить цену
Подробное описание
Nikon Eclipse Ts2R
НОВИНКА
Инвертированный микроскоп
Быстрый просмотр Подробное описание
Инвертированный исследовательский микроскоп Nikon Eclipse Ts2R
Инвертированный микроскоп Nikon Eclipse Ts2R – это новая модель в линейке Nikon. Микроскоп удобен в использовании и имеет большой выбор аксессуаров, что делает его незаменимым для решения задач в области медицины и биологии
Запросить цену
Подробное описание
Nikon Eclipse Ts2R
Инвертированный микроскоп Nikon Eclipse Ts2R – это новая модель в линейке Nikon. Микроскоп удобен в использовании и имеет большой выбор аксессуаров, что делает его незаменимым для решения задач в области медицины и биологии
Свяжитесь со специалистом удобным для Вас способом:
(495) 223-40-00 | [email protected]
Запросить цену
Подробное описание
Nikon Eclipse Ti
ВЫПУСК ПРЕКРАЩЕН
Инвертированный микроскоп
Быстрый просмотр Подробное описание
Инвертированный исследовательский микроскоп Nikon ECLIPSE Ti
Микроскопы серии ECLIPSE Ti являются инструментами, имеющими решающее значение для передовых исследований в биологии, медицине и фармацевтике. Продуманная автоматика и применение модульной концепции Nikon делают Ti идеальным для таких задач, как конфокальная микроскопия, FRET и фотообесцвечивание/фотоактивация для изучения взаимодействия флуоресцентных молекул белка в живых клетках и тканях. Микроскоп Ti поддерживает различные виды регистрации изображений и методы его анализа, такие как многомерная регистрация изображений через заданные интервалы времени для получения временной, пространственной и спектральной информации о быстрых, динамичных процессах в живых клетках
Запросить цену
Подробное описание
Nikon Eclipse Ti
Микроскопы серии ECLIPSE Ti являются инструментами, имеющими решающее значение для передовых исследований в биологии, медицине и фармацевтике. Продуманная автоматика и применение модульной концепции Nikon делают Ti идеальным для таких задач, как конфокальная микроскопия, FRET и фотообесцвечивание/фотоактивация для изучения взаимодействия флуоресцентных молекул белка в живых клетках и тканях. Микроскоп Ti поддерживает различные виды регистрации изображений и методы его анализа, такие как многомерная регистрация изображений через заданные интервалы времени для получения временной, пространственной и спектральной информации о быстрых, динамичных процессах в живых клетках
Свяжитесь со специалистом удобным для Вас способом:
(495) 223-40-00 | systems@tokyo-boeki. ru
Запросить цену
Подробное описание
Nikon C2+, C2si+
Конфокальный микроскоп
Быстрый просмотр Подробное описание
Конфокальный микроскоп Nikon C2+, C2si+
Конфокальный микроскоп Nikon C2+ является на данный момент незаменимым инструментом для лабораторной микроскопии. Система C2+ имеет невысокую стоимость, она стабильна и проста в использовании и позволяет достичь скорости получения изображения 100 кадров в секунду, а также имеется возможность спектрального анализа.
Запросить цену
Подробное описание
Nikon C2+, C2si+
Конфокальный микроскоп Nikon C2+ является на данный момент незаменимым инструментом для лабораторной микроскопии. Система C2+ имеет невысокую стоимость, она стабильна и проста в использовании и позволяет достичь скорости получения изображения 100 кадров в секунду, а также имеется возможность спектрального анализа.
Свяжитесь со специалистом удобным для Вас способом:
(495) 223-40-00 | [email protected]
Запросить цену
Подробное описание
Nikon A1+, A1R+
Конфокальный микроскоп
Быстрый просмотр Подробное описание
Конфокальный микроскоп Nikon A1+, A1R+
Инновационная серия конфокальных сканирующих микроскопов А1+ компании Nikon позволяет получать высококачественные изображения клеток и молекулярных процессов с непревзойденной скоростью до 420 кадров в секунду. А1 удовлетворит самые изысканные требования в области визуализации. Возможен спектральный анализ и комплектация гибридным детектором на GaAsP
Запросить цену
Подробное описание
Nikon A1+, A1R+
Инновационная серия конфокальных сканирующих микроскопов А1+ компании Nikon позволяет получать высококачественные изображения клеток и молекулярных процессов с непревзойденной скоростью до 420 кадров в секунду. А1 удовлетворит самые изысканные требования в области визуализации. Возможен спектральный анализ и комплектация гибридным детектором на GaAsP
Свяжитесь со специалистом удобным для Вас способом:
(495) 223-40-00 | [email protected]
Запросить цену
Подробное описание
Nikon A1 MP+, A1R MP+
Конфокальный микроскоп
Быстрый просмотр Подробное описание
Мультифотонный конфокальный микроскоп Nikon A1 MP+, A1R MP+
Мультифотонный конфокальный лазерный микроскоп А1MP+ компании Nikon позволяет визуализировать сверхглубокую динамику в живых организмах со скоростью до 420 кадров в секунду. Возможно использование инфракрасного лазера 1300 нм и нового детектора NDD, не требующего десканирования, на базе GaAsP с возможностью получения изображений на глубине свыше 1,4 мм
Запросить цену
Подробное описание
Nikon A1 MP+, A1R MP+
Мультифотонный конфокальный лазерный микроскоп А1MP+ компании Nikon позволяет визуализировать сверхглубокую динамику в живых организмах со скоростью до 420 кадров в секунду. Возможно использование инфракрасного лазера 1300 нм и нового детектора NDD, не требующего десканирования, на базе GaAsP с возможностью получения изображений на глубине свыше 1,4 мм
Свяжитесь со специалистом удобным для Вас способом:
(495) 223-40-00 | [email protected]
Запросить цену
Подробное описание
Nikon N-STORM
Микроскоп сверхвысокого разрешения
Быстрый просмотр Подробное описание
Микроскоп сверхвысокого разрешения Nikon N-STORM
Система N-STORM поступается временным разрешением ради пространственного разрешения, обеспечивая невероятное пространственное разрешение изображения, приблизительно 20 нм, что в 10 или более раз превышает значение обычного оптического микроскопа. Микроскопия стохастической оптической реконструкции (STORM) теперь делает возможным наблюдение за межбелковыми взаимодействиями на молекулярном уровне
Запросить цену
Подробное описание
Nikon N-STORM
Система N-STORM поступается временным разрешением ради пространственного разрешения, обеспечивая невероятное пространственное разрешение изображения, приблизительно 20 нм, что в 10 или более раз превышает значение обычного оптического микроскопа. Микроскопия стохастической оптической реконструкции (STORM) теперь делает возможным наблюдение за межбелковыми взаимодействиями на молекулярном уровне
Свяжитесь со специалистом удобным для Вас способом:
(495) 223-40-00 | [email protected]
Запросить цену
Подробное описание
Nikon N-SIM
Микроскоп сверхвысокого разрешения
Быстрый просмотр Подробное описание
Микроскоп сверхвысокого разрешения Nikon N-SIM
С помощью высокочастотного структурированного освещения модель N-SIM достигает разрешения в 115 нм, что ранее считалось недостижимым результатом для оптического микроскопа. Кроме того, обеспечивая временное разрешение 0,6 сек/кадр, микроскоп N-SIM делает возможным съемку с временным разрешением молекулярных взаимодействий живых
клеток с высоким пространственным разрешением. Живые образцы можно держать в оптимальных условиях окружающей среды с помощью инкубатора установленного на предметный столик и специально разработанного для N-SIM
Запросить цену
Подробное описание
Nikon N-SIM
С помощью высокочастотного структурированного освещения модель N-SIM достигает разрешения в 115 нм, что ранее считалось недостижимым результатом для оптического микроскопа. Кроме того, обеспечивая временное разрешение 0,6 сек/кадр, микроскоп N-SIM делает возможным съемку с временным разрешением молекулярных взаимодействий живых
клеток с высоким пространственным разрешением. Живые образцы можно держать в оптимальных условиях окружающей среды с помощью инкубатора установленного на предметный столик и специально разработанного для N-SIM
Свяжитесь со специалистом удобным для Вас способом:
(495) 223-40-00 | systems@tokyo-boeki. ru
Запросить цену
Подробное описание
Генетики получили первую «трехмерную фотографию» генома человека
https://ria.ru/20180828/1527379628.html
Генетики получили первую «трехмерную фотографию» генома человека
Генетики получили первую «трехмерную фотографию» генома человека — РИА Новости, 28.08.2018
Генетики получили первую «трехмерную фотографию» генома человека
. Молекулярные биологи из США получили первую детальную трехмерную карту генома, на которой можно увидеть, как расположены все известные гены и участки… РИА Новости, 28.08.2018
2018-08-28T16:53
2018-08-28T16:53
2018-08-28T16:53
/html/head/meta[@name=’og:title’]/@content
/html/head/meta[@name=’og:description’]/@content
https://cdnn21.img.ria.ru/images/sharing/article/1527379628.jpg?15273777561535464391
сша
РИА Новости
1
5
4. 7
96
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/
2018
РИА Новости
1
5
4.7
96
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/
Новости
ru-RU
https://ria.ru/docs/about/copyright.html
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/
РИА Новости
1
5
4.7
96
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/
РИА Новости
1
5
4.7
96
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/
РИА Новости
1
5
4.7
96
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og. xn--p1ai/awards/
открытия — риа наука, сша
Открытия — РИА Наука, Наука, США
МОСКВА, 28 авг – РИА Новости. Молекулярные биологи из США получили первую детальную трехмерную карту генома, на которой можно увидеть, как расположены все известные гены и участки «мусорной» ДНК внутри ядра живой клетки. Она была представлена в статье в Journal of Cell Biology.
24 июля 2015, 13:16
Ученые из МГУ выяснили, почему хромосомы заплетаются в «спагетти»Российские физики нашли математическое объяснение тому, почему хромосомы в наших клетках сплетены в своеобразное подобие перемешанных спагетти или спутанной лески, в так называемый фрактальный клубок, а не плавают по отдельности.
«Мы пока не понимаем, почему ДНК уложена в ядре подобным образом. С другой стороны, уже сейчас можно сказать, что даже небольшие сдвиги хромосом, на несколько сотен нанометров в ту или другую сторону, могут сильно влиять на уровень активности генов», — рассказывает Эндрю Бельмонт (Andrew Belmont) из университета Иллинойса в Урбане (США).
Вопреки представлениям обывателей, хромосомы приобретают характерную Х-образную форму и становятся хорошо заметными в микроскоп только во время деления клетки. Во время интерфазы, периода спокойствия, они теряют свою форму и превращаются в своеобразный клубок из тесно переплетенных нитей, чей «формат» упаковки и сам факт существования вызывает большой интерес со стороны биологов и физиков.
Этот клубок, напоминающий по своей структуре брикет лапши быстрого приготовления, как предположили советские ученые еще в 1988 году, представляет собой так называемый фрактальный клубок – особую математическую структуру из пересекающихся кривых, чьи завитки повторяют, как и все фрактальные объекты, форму всей хромосомной нити.
Молекулярные биологи, как отмечает Бельмонт, давно пытаются «распутать» его и понять, зачем клетка упаковывает генетический код подобным образом и как расположены внутри него различные гены, жизненно важные для функционирования всех тканей тела.
18 июля 2016, 22:00
Ученые разгадали главную «женскую» загадку человеческого геномаГенетики выяснили, как «лишняя» женская Х-хромосома сворачивается в так называемое тельце Барра и остается неактивной в организме здоровых женщин и самок млекопитающих.
Его команда смогла решить эту задачу, воспользовавшись тем, что в ядре присутствует большое количество так называемых «спеклов» – плотных шарообразных структур РНК и белков, разделяющих отдельные нити «клубка» хромосом. Они, как сегодня считают ученые, играют важную роль в чтении генов, однако их точную роль еще предстоит раскрыть.
Бельмонт и его коллеги поменяли геном человеческих клеток таким образом, что внутри спеклов начали накапливаться молекулы особого фермента, пероксидазы хрена.
Он одновременно исполняет две задачи – «подсвечивает» нити хромосом, окисляя различные органические соединения, и помечает отдельные гены при помощи тирамида, одной из вырабатываемых им молекул. Как правило, чем ближе ген находится к спеклу, тем больше тирамидовых меток появится на его поверхности.
Подобный трюк, как объясняет биолог, позволяет не только получить точную трехмерную фотографию «клубка» хромосом, но и узнать, какие гены находятся в произвольной точке этой структуры. Для этого достаточно извлечь ДНК из клетки, расшифровать ее структуру и подсчитать число меток на поверхности каждого гена.
29 ноября 2016, 10:59
Ученые из России впервые увидели, как клетки «разматывают» ДНКРоссийские ученые и их американские коллеги выяснили, как работает белок FACT, «распаковывающий» свернутую ДНК клеток без затрат энергии, что поспособствует созданию новых лекарств от рака и раскрытию секретов зарождения жизни на Земле.
Опираясь на подобные идеи, генетики получили полноценные трехмерные фотографии хромосом в ядре раковых клеток, извлеченных из организма людей, страдавших от лейкемии.
Первый же анализ этих снимков, как отмечает Бельмонт, неожиданно указал на то, что активность генов не зависит от того, как близко к центру ядра они находятся, о чем говорили прошлые попытки распутать «хромосомный клубок». На самом деле, самые «читаемые» гены расположены неподалеку от спеклов и других полостей, причины чего еще предстоит выяснить.
Тайну герпеса разглядели в электронный микроскоп / Наука / Независимая газета
Портал накачки ДНК в вирус с красными «щупальцами» к шапочке (cap). Иллюстрация Physorg
Слово «вир» (Vir) у римлян обозначало грубого мужлана, зачастую смертельно опасного (однокоренные слова любопытны: триумвират, ковирия – курия, вирильность – мужественность). Неудивительно, что Луи Пастер, пользовавшийся «искаженной» латынью, назвал поначалу «вирулентные» микроорганизмы вирусами, а созданную им науку микробиологией. И вирусы до 70-х годов ХХ века называли фильтрующимися, потому что они проходят сквозь мельчайшие поры фарфоровых фильтров, не пропускающих бактерии и кокки.
Стереометрия учит, что при минимальной затрате материала сфера вмещает максимальный внутренний объем, чем широко пользуются вирусы, имеющие в большинстве сферическую (вернее икосаэдрическую – 20-гранную) форму. Хотя есть и исключения, например палочковидный вирус табачной мозаики, нитчатый вирус эболы и некоторые бактериофаги, «пожирающие» те же кишечные палочки E. coli.
Коронавирус, как и «ползучий» вирус герпеса (сравните: герпетология, изучающая «гадов ползучих»), который вызывает весеннюю лихорадку на губах, а также саркому Капоши (свирепствующую у людей с ВИЧ), трудно излечим. Обусловлено это их изменчивостью, которая присуща всему живому, против которой бессильны иммунный ответ и лекарства. Неудивительно, что ученые ищут консервативные мишени воздействия. То есть протеины внутренних ферментов и нуклеокапсида, защищающего вирусные нуклеиновые кислоты (ДНК или РНК). К сожалению, это непросто. Тот же коронавирус чуть ли не каждый день приносит сюрпризы.
Всем памятна печальная судьба океанского лайнера «Алмазная принцесса» (Diamond Princess): 18% пассажиров оказались зараженными, но не имели внешних проявлений. Врачи обследовали 77 пар, в которых один заразил другого. Но винить первого не в чем, потому что в половине случаев заражение произошло еще до появления первых симптомов. Около сотни, 94 человека, имели viral shedding (VS), или выделение вируса до начала заболевания.
В августе китайцы показали, что очагом заражения могут стать общественные туалеты, оборудованные смывающимися писсуарами. Причем VS тем больше, чем выше скорость смыва. Но вернемся к вирусным сферам, упомянутым выше.
Сотрудники Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе показали с помощью криоэлектронного микроскопа, что ДНК герпес-вируса (HSV) «пакуется» под большим давлением, достигающим внутри частицы… десятков атмосфер! Внутреннее «ядро» при этом представлено хаотически спутанной ДНК, на которое, как на шпульку (spool), намотаны двухцепочные спирали ДНК. Нечто подобное имеет место в хромосомах, в которых ДНК также навита на белковые шпульки, называемые нуклеосомами.
Для «закачки» ДНК в полость вириона у него имеется протеиновый комплекс, который ученые назвали порталом (portal). Портал закрывается крышкой, которая удерживается белковыми щупальцами длиной 20 нанометров. Вполне возможно, что белки портала станут мишенями будущих лекарств и иммунотерапий. К этому можно добавить, что сотрудники университета в японском г. Кобе предложили вакцину против одного из герпес-вирусов, проникающих в клетки человека с помощью белка-рецептора на их поверхности.
Известно, что герпес-вирусы относятся к латентным, то есть могут пребывать в спящем состоянии, скажем, в нейронах. В Гарвардском и Лиссабонском университетах выявили один из протеинов латентности, назвав его красивым именем LANA (Latency-Associated Nuclear Antigen – ядерный антиген, связанный с латентностью). Авторы отметили высокую степень консервативности LANA у различных герпес-вирусов. Статья с результатами исследования опубликована в журнале PLOS.
Другим важным белком является АРЕ (A Purinic/A Pyrimidinic Endonuclease), представляющий собой фермент починки ДНК. АРЕ необходим для нормальной работы так называемых «вилок»-forks, возникающих при расхождении цепей ДНК во время ее синтеза (Science). АРЕ также «добавляет» смертности клеткам с мутациями гена BrCa, приводящим к раку груди.
Летальность клеток получила название апоптоз (от греч. – опадание листьев, падеж скота). Для четкого мониторинга апоптоза при фототерапии в Университете науки и технологии китайского г. Хефея предложены наночастицы, которые вне клетки пребывают в выключенном (Off) режиме. Аномальные клетки активно поглощают частицы, после чего становятся мишенью воздействия красным светом с длиной волны 808 нанометров, глубоко проникающим в ткани. Частицы с СВТ – Циано-аминоБензо-Тиазолом – переходят в режим «On», стимулируя ферменты апоптоза. Один из них разрушает наносферы. При этом из них высвобождается светящийся агент, по флюоресценции которого можно судить об успехе фототермотерапии в режиме реального времени.
Выделяем ДНК банана в домашних условиях / Хабр
В анонсах мероприятий, которые проходят в Leader-ID, можно встретить неожиданные вещи. К примеру — мастер-класс по выделению молекул ДНК, для которого достаточно «оборудования» и «реагентов», которые есть на любой кухне. Этот эксперимент можно провести вместе с детьми — погрузить их, так сказать, в мир биологии и химии.
В основе поста — рассказ Юлии Зайцевой, кандидата биологических наук факультета биологии и экологии Ярославского Демидовского университета (ЯрГУ). Если вам удобнее формат видео, оно тут.
Прежде чем мы начнем смешивать ингредиенты, буквально несколько слов про ДНК, ее структуру и роль в биологических процессах. А еще о том, как так вышло, что эту молекулу можно наблюдать невооруженным глазом. Если вы все это знаете, переходите сразу к пошаговой инструкции.
Структура ДНК
С химической точки зрения дезоксирибонуклеиновая кислота, или ДНК, — это длинная полимерная молекула, состоящая из блоков, нуклеотидов.
Каждый нуклеотид включает:
остаток фосфорной кислоты,
сахар — дезоксирибозу,
и одно из четырех азотистых оснований.
Эти блоки в ДНК повторяются.
Азотистые основания — это гетероциклические органические соединения, производные пиримидина и пурина. В ДНК встречается четыре вида азотистых оснований. Для удобства их обозначают буквами:
аденин (А),
гуанин (Г),
тимин (Т),
цитозин (Ц).
Азотистые основания разных нуклеотидов соединяются между собой водородными связями согласно принципу комплементарности. Аденин образует связь с тимином.
А гуанин с цитозином.
В итоге молекула ДНК состоит из двух цепей нуклеотидов, ориентированных азотистыми основаниями друг к другу.
Такая двухцепочечная молекула закручена по винтовой линии.
Эту структуру ошибочно называют спиралью, но на самом деле это двойной винт.
Роль молекулы ДНК
С биологической точки зрения ДНК — макромолекула, которая обеспечивает хранение, передачу и реализацию генетической программы развития и функционирования живых организмов.
Биологическая информация в ДНК хранится в виде генетического кода, состоящего из последовательности четырех видов нуклеотидов. Так как различаются нуклеотиды только азотистыми основаниями, по основаниям их и называют:
Размер молекулы ДНК
Перейдем к математике — посчитаем длину человеческой ДНК.
Общее число нуклеотидов в геноме человека — 3,2 миллиарда. Линейная длина одного нуклеотида — 0,34 нанометра. Перемножив эти показатели, получаем следующее:
Что суммарная длина молекул ДНК в одной клетке — около двух метров (общая длина цепей в двухспиральной молекуле). При этом линейная длина самой клетки — всего 30 мкм.
А размер ее ядра, в котором располагается молекула ДНК, еще в несколько раз меньше.
Как же два метра ДНК помещается в клетку, диаметр которой почти в 70 тысяч раз меньше?
За это отвечает механизм особой укладки ДНК в клетке, который называется компактизация. ДНК, как нить, накручивается на катушку из специальных белков — гистонов. «Катушки» сближаются друг с другом, образуя структуру, напоминающую баранки на нитке. А потом эта «нитка с баранками-катушками» формирует сложные петли.
При такой укладке длина молекулы ДНК уменьшается в 100 тыс. раз
Если бы мы провели такую компактизацию в макромире, то смогли бы нитку длиной с Останкинскую башню (~500 метров) уложить в спичечный коробок.
Длина молекул ДНК в теле человека
В общей сложности в нашем теле ученые насчитывают около 70 триллионов клеток (своих и чужих — тут мы не забываем про микробиом). Наименьшая длина молекулы ДНК — 1,5 м.
Если умножить ее на количество клеток, получится, что общая длина цепочек ДНК в организме человека — более 100 триллионов метров. Это грандиозная величина! Она чуть ли не в 1000 раз больше, чем расстояние от Земли до Солнца (150 млн километров).
Пошаговая инструкция по выделению молекул ДНК
Для эксперимента подойдет любой растительный материал. Проще работать с тем, что легче измельчить, например мякоть банана.
Чтобы извлечь ДНК из ядра растительной клетки, нам потребуются:
ступка с пестиком, дома можно использовать блендер;
воронка;
стеклянная посуда: колба, стакан, пробирка — или любая другая прозрачная емкость, которая найдется на вашей кухне;
фильтровальная бумага или марля;
хлорид натрия (поваренная соль) — 1,5 г;
гидрокарбонат натрия (сода) — 5 г;
весы, позволяющие взвешивать от одного до нескольких грамм; в отсутствие весов для соли и соды можно использовать мерные ложки — здесь главное соблюсти пропорции ингредиентов;
детергент (лат. detergio — стираю) — это разновидность поверхностно-активного вещества, которое уменьшает поверхностное натяжение воды и способствует ее проникновению в поры и между волокнами; детергенты помогают отмывать что угодно от грязи; в домашних условиях в качестве детергента можно использовать мыло, средство для посуды или шампунь;
дистиллированная вода — 120 мл;
95%-й этиловый спирт.
Шаг 1. Готовим буферный раствор
Буферными (англ. buff — смягчать удар) называют растворы с определенной устойчивой концентрацией водородных ионов. Проще говоря, pH такого раствора почти не меняется, даже если мы добавляем в него кислоту или щелочь.
Чтобы приготовить буферный раствор для нашего эксперимента, наливаем в колбу 120 мл дистиллированной воды и добавляем в нее 1,5 грамма хлорида натрия. В домашних условиях можно использовать поваренную соль, это, конечно, не химически чистый NaCl, но для нашей миссии подойдет.
Далее взвешиваем и добавляем в раствор 5 грамм гидрокарбоната натрия (дома используем соду).
Если дома не нашлось инструментов для взвешивания 1,5 г соли и 5 г соды, можно приготовить больший объем буферного раствора с сохранением пропорции ингредиентов. В этом случае для последующих шагов берем только часть раствора.
После добавления перемешиваем содержимое колбы до полного растворения.
Если у вас вдруг нет такой замечательной магнитной мешалки — воспользуйтесь ложкой (тут был подмигивающий смайл, но модератор его удалил)
Шаг 2. Смешиваем буферный раствор с детергентом
В качестве детергента мы используем средство для мытья посуды. Нам будет вполне достаточно 50–60 мл. Добавляем его в буфер и перемешиваем полученную смесь в течение трех минут.
Шаг 3. Подготовка сырья для извлечения ДНК
Мякоть банана тщательно измельчаем до однородного состояния. Дома это удобнее сделать блендером.
Шаг 4. Разрушение клеточных стенок
«Полученную кашицу…» В смысле, к полученной массе добавляем холодную смесь буферного раствора с детергентом.
Тщательно перемешиваем.
Детергент разрушает клеточные мембраны и мембраны ядер клеток. Таким образом, нити ДНК окажутся свободно плавающими.
Шаг 5. Получение молекул в растворе
Разрушив клеточные стенки, удаляем их: для этого фильтруем раствор в течение 10–15 минут при помощи воронки с фильтром. В нашем случае мы используем фильтровальную бумагу, но дома можно взять ткань или даже марлю.
Шаг 6. Визуализация
К полученному фильтрату по стенке сосуда под острым углом осторожно приливаем охлажденный в морозилке 95% этиловый спирт, чтобы он не перемешивался с содержимым. Добавляем сколько не жалко. Но в целом количества, равного половине имеющегося в колбе фильтрата, будет достаточно.
Предчувствуя вопрос из зала, скажу сразу — нет, водка тут не подойдет.
И вот на границе раздела двух жидкостей мы наблюдаем, как постепенно появляются белые нити ДНК.
Из всех клеточных компонентов только ДНК быстро выпадает в осадок в спирте, образуя видимые глазу белые нити. Все остальные компоненты остаются в водной фазе.
Используя этот метод, можно выделить ДНК из любого растительного материала. На практике хорошие результаты получаются с луком, чесноком, бананами и томатами. В общем, дети будут довольны.
ДНК под микроскопом – электронная и атомно-силовая микроскопия
Электронная и атомно-силовая микроскопия
Обзор
ДНК (дезоксирибонуклеиновая кислота) представляет
содержит в себе все инструкции и информацию об организме. Этот
означает, что ДНК содержит информацию о том, как организм будет
развиваться, как она живет и размножается и т. д. Таким образом, ДНК может быть описана
как чертеж живого организма.
Учитывая, что молекулы ДНК обнаружены
внутри клеток они слишком малы, чтобы их можно было увидеть невооруженным глазом. Для этого
причина, микроскоп необходим. Хотя можно увидеть ядро
(содержащие ДНК) с помощью светового микроскопа нити/нити ДНК могут быть
просматриваются с помощью микроскопов, которые обеспечивают более высокое разрешение.
Микроскопия
Для просмотра ДНК, а также ряд других
белковых молекул используется электронный микроскоп. В то время как типичный свет
микроскоп ограничен только разрешением около 0,25 мкм, электронный
микроскоп имеет разрешение около 0,2 нанометра, что делает его
можно увидеть более мелкие молекулы. Это достигается тем, что электрон
микроскопы используют электронные лучи, а не видимый свет, используемый для освещения
микроскопы.
Электронная микроскопия ДНК
Требования
- Электронный микроскоп
- Соли тяжелых металлов (свинец)
perchlorate, uranyl acetate, lanthanum nitrate) - DNA sample (nucleic acids)
- Formaldehyde
Procedure
For this procedure, the steps involved:
- Spraying DNA на сетку
со стеклянным распылителем (рекомендуется использовать свежесколотую слюду) - Добавить латексные сферы — Латекс
сферы или ферритин, используемые здесь, служат эталонными частицами - Распространение ДНК
раствор/препарат и белок (от 1:10 до 1:100) на поверхности воды в Ленгмюре
корыто — это известно как метод Кляйншмидта. Он используется для
Распределение нуклеиновой кислоты в белке с образованием белковой пленки, удерживающей ДНК на
поверхности
Когда препарат готов, он готов к
окрашивание
Процедура окрашивания
- Наносится нуклеиновая кислота
к сеткам и погрузить в красящий раствор на время от 10 до 4 минут.
часы. - Промойте решетки с помощью
бидистиллированная вода при рН 6,0 трижды и просмотр под микроскопом - В случае, если
окрашенная сетка не будет просматриваться сразу, то их можно сохранить в
вакуумные эксикаторы над фосфатом P205
Наблюдение
Использование тяжелых солей позволяет повысить контрастность
что позволяет увидеть отдельные молекулы ДНК
Было показано, что STEM-микроскопия работает в
режим темного поля, что обеспечивает высокую контрастность биологических молекул. Потому что
изображений в темном поле, этот метод также показал отличные результаты.
Преимущество в том, что он позволяет напрямую визуализировать неокрашенные нити
ДНК.
Благодаря высокой контрастности
при условии, что этот метод также позволяет исследователям идентифицировать
любые проблемы с образцом. Процедура для этой техники очень похожа
к типичной электронной микроскопии для ДНК. Однако с помощью STEM исследователи
получить информацию о массе и структуре одноцепочечной ДНК.
Криоэлектронная микроскопия является одним из
методы, которые показали себя особенно успешными в выявлении
структура ДНК.
В отличие от просвечивающего электронного микроскопа, крио-ЭМ использует
замороженные образцы и электронные лучи, которые мягче рассматривают образец. Этот
позволяет исследователям просматривать биологические молекулы, не причиняя вреда
их в процессе.
Для этого метода небольшое количество пробы
в решении сначала применяется к ЭМ сетке аналогично процессу, используемому для просмотра
Нить ДНК под электронным микроскопом (ЭМ). Тогда сетка с тонким слоем
погружают в жидкий этан (при температуре -180 градусов по Цельсию), чтобы уловить молекулы в воде
кристалл/лед. Это гарантирует, что остатки образца не будут разрушены при хранении.
рассматривать под микроскопом.
Здесь стоит отметить, что образцы, подготовленные для
этот метод (образцы Cryo-EM) имеет тенденцию быть очень чувствительным к электронам
наносить ущерб. По этой причине для
убедитесь, что образец не поврежден.
При воздействии на образец малых доз
электронов слой льда вокруг образца также помогает защитить
образец в процессе.
Благодаря последним достижениям в этой технике,
исследователи смогли разработать улучшенную технику крио-ЭМ, известную как криоэлектрон.
томография (КЭТ). С помощью этой методики стало возможным для исследователей
для разработки трехмерных структур различных белков и нитей ДНК.
По существу,
процесс включает в себя захват множества изображений образца под разными углами
и использование изображений для построения трехмерной структуры. Используя этот метод, исследователи
удалось разработать и представить множество 3D-изображений нитей ДНК
показывая структуру ДНК с разных сторон.
Кроме методов электронной микроскопии
используются для изучения ДНК такие методы, как атомно-силовая микроскопия (АСМ).
используется с той же целью. Используя эту технику, исследователи смогли измерить длину этих нитей.
Требования (для АСМ)
Для этой методики некоторые материалы
обязательно включают:
- Образцы ДНК (например, X174
ДНК вириона) - АСМ-микроскоп
- Свежесколотая рубиновая слюда
круг - Ацетат магния
- Вода
- Переменный тлеющий разряд
- Формальдегид
Процедура
- Для одноцепочечной ДНК,
процедура включает следующие этапы: - Замачивание свежесколотого рубина
слюдяные круги в 33 мМ ацетата магния на срок от 4 до 24 часов - Ультразвуковая обработка в воде Millipore
около 5 минут, чтобы удалить излишки ацетата магния - Используйте сжатый воздух для
сушка - Воздействие тлеющим разрядом переменного тока
примерно на 20 секунд в воздухе 100 miltorr - Почти сразу инвертировать
кружки в каплях цепей ДНК объемом около 7 микролитров (одинарные нити)
в 0,5 % формальдегида и 15 мМ ацетата аммония. Наносится на
парафильм - Дать постоять около 4
минут и промойте слюду примерно 3 каплями воды - Просушите сжатым воздухом
- Если она не будет использоваться
немедленно хранить препарат в эксикаторе на дриерите
Для двухцепочечной ДНК используется та же процедура, но
формальдегид и ацетат аммония не используют.
Визуализация
- Во время визуализации
(АСМ-визуализация) процесс проводили в 100-процентном пропаноле с использованием
либо Nanoscope II, либо III AFM. Здесь для нанесения пропанола использовалось уплотнительное кольцо.
положив его на образец в приборе. В процессе участвовало: - Нанесение капли спирта
на кантилевер в жидкостной ячейке - Позиционирование кантилевера
над уплотнительным кольцом и надежно зажат - Убедитесь, что количество
жидкости было достаточно (это определялось путем проверки отсутствия пузырьков
на световом пути)
Во время визуализации применялась минимальная сила. Это гарантировало, что
кантилевер не поднял образец.
Для измерения длины цепей ДНК с помощью
При этом изображения сначала увеличивают, а по ДНК укладывают тонкую цепочку.
контуры. Однако было показано, что лучший способ проведения измерений
включают прямое измерение вида сверху изображений ДНК в наноскопе.
Этот метод просто включает в себя суммирование заданных точек на изображении.
СТМ также можно использовать для просмотра молекул ДНК.
Он способен отображать объекты на атомарном уровне, что делает его хорошим инструментом.
для просмотра молекул ДНК.
Для этого метода можно использовать несколько методов
для подготовки образца к визуализации, к ним относятся:
Метод №1
- Поместите каплю ДНК
раствор на подложке - Дать высохнуть на воздухе (воздух
сухой) - Содержит раствор в
10 мМ хлорида калия для стабилизации ДНК - Обработайте раствор ультразвуком, используя
a - Ультразвуковой зонд Biosonik IV
около 30 минут при 160 Вт - Визуализация — Визуализация с использованием СТМ
можно выполнить непосредственно на слое
Метод №2 — этот метод аналогичен первому
метод, но включает вакуумную сушку раствора и содержание его в 10 мМ
ацетат аммония. Обработка ультразвуком также была пропущена.
Метод №3
- Поместите 10 микролитров
дистиллированная вода на куске парафильма — Вода заставляет фаг высвобождаться
DNA - Добавьте 10 микролитров капли
лизированных частиц ДНК (лизированный бактериофаг Т7) - Ненадолго поместите субстрат
на капле для сбора лизированных частиц
После визуализации можно идентифицировать
ДНК через их высоту и ширину. Здесь хорошо видны нити ДНК.
расположены параллельно друг другу.
Один из последних методов немного отличается
от других и включает растворение ДНК в водном растворе и размещение
его в слой высокоориентированного графита, прежде чем дать ему высохнуть на воздухе. Здесь,
наконечники из вольфрамовой проволоки используются при сканировании в атмосферных условиях.
условия. Сканирование дает изображения двойной спирали ДНК с высоким разрешением.
Вольфганг Шонерт, оригинальный автор на GSI. de
http://web-docs.gsi.de/~bio/RESEARCH/rastermicro.html
Структура ДНК
Как уже упоминалось, ДНК (дезоксирибонуклеиновая кислота)
несет в себе генетический, наследственный материал и находится в ядре клетки
каждого организма. По сути, нити ДНК состоят из повторяющихся паттернов.
из шести молекул, которые включают; дезоксирибоза (пятиуглеродный сахар) фосфат
группы, а также четыре азотистых основания (цитозин (С), тимин (Т), аденин (А)
и гуанин (G)).
Линейный порядок оснований представляет собой один из самых
важные особенности ДНК, учитывая, что их спаривание позволяет выполнять важное кодирование
информации, необходимой для развития и жизнедеятельности организма. Структура
ДНК (двойной спирали) имеет большое значение, учитывая, что она служит для
защитить основные атомы.
* Нуклеотиды являются основными единицами ДНК. Каждый
нуклеотид состоит из одной молекулы сахара, одного фосфата
молекула и одно азотистое основание.
См. также:
- Вирусы под микроскопом
- Атом под микроскопом
- Изучение хромосом
Что такое ближнепольная сканирующая оптическая микроскопия?
Возврат в электронную микроскопию
Возврат из ДНК под микроскопом в MicroscopeMaster Home
сообщить об этом объявлении
Каталожные номера
Вальтер Штоккениус. Электронная микроскопия ДНК
Молекулы, «окрашенные» солями тяжелых металлов.
Хеле Г. Хансма Робер Л. Зиншаймер Мин-Ця Ли и
Пау К.Хансма (1992)Атомно-силовая микроскопия одноцепочечной и двухцепочечной ДНК.
http://iopscience.iop.org/article/10.7567/JJAP.56.08LB02
http://cs.boisestate.edu/~amit/teaching/342/lab/structure.html
Узнайте, как размещать рекламу на MicroscopeMaster!
Репликация ДНК под микроскопом
Университетом науки и технологий короля Абдаллы
Ученые KAUST используют криогенную электронную микроскопию для исследования трехмерной структуры и функции ключевых белковых комплексов, участвующих в репликации и восстановлении ДНК. Кредит: КАУСТ; Хено Хван
Криогенная электронная микроскопия (крио-ЭМ) позволила исследователям изучить, как механизм репликации ДНК собирается в местах, где ДНК повреждена.
Клеточная ДНК постоянно подвергается воздействию как эндогенных, так и экзогенных агентов, повреждающих ДНК, таких как активные формы кислорода и УФ-излучение. Чтобы уменьшить биологические последствия повреждения ДНК, все живые организмы развили механизмы, позволяющие переносить и восстанавливать повреждения ДНК, чтобы гарантировать точное наследование генетической информации. Один из таких механизмов, называемый трансфузионным синтезом (TLS), позволяет репликации ДНК проходить через нерепарированные повреждения ДНК.
TLS предполагает временную замену высокоточных ДНК-синтезирующих ферментов (репликативных ДНК-полимераз) специализированными TLS-полимеразами низкой точности, которые могут обеспечить выживание клеток за счет внесения мутаций. Мутагенная и передаточная синтетическая активность TLS-полимераз может привести к тому, что нормальные клетки станут раковыми, а раковые клетки станут устойчивыми к лекарствам.
TLS-полимераза Y-семейства Pol K способна осуществлять синтез ДНК на нескольких поврежденных основаниях и привлекается к повреждениям ДНК с помощью ядерного антигена пролиферирующих клеток (PCNA). Предыдущие исследования показали, что PCNA регулируется убиквитинированием. «Добавление одной молекулы убиквитина к остатку лизина 164 (K164) PCNA облегчает рекрутирование и удержание полимераз TLS в местах повреждения, но структурная основа взаимодействия между этими полимеразами и убиквитинированным PCNA плохо изучена», — говорит структурный биолог. Альфредо Де Бьясио из KAUST.
Группа Де Биазио сотрудничает с лабораторией под руководством Самира Хамдана, эксперта по анализу одиночных молекул репликации ДНК человека, с 2018 года. Они использовали крио-ЭМ для исследования трехмерной структуры и функции ключевого белка. комплексы, участвующие в репликации и репарации ДНК.
Их последнее исследование описывает крио-ЭМ реконструкцию полноразмерного человеческого Pol K , связанного с ДНК, входящим нуклеотидом и немодифицированным PCNA или моно-убиквитилированным PCNA, с разрешением, близким к атомному. Они обнаружили, что в отсутствие ДНК структура Pol K , связанный с PCNA, обладает высокой гибкостью, что позволяет предположить, что связывание с ДНК необходимо для образования жесткого и активного комплекса.
Мухаммад Техсин, старший научный сотрудник группы Хамдана и соавтор исследования, провел ключевые функциональные исследования, выясняющие, как убиквитинирование PCNA модулирует активность Pol K .
«Наши данные обеспечивают структурную основу для объяснения того, как PCNA привлекает полимеразу TLS Y-семейства к участкам повреждения ДНК», — объясняет Техсин. Из-за высокой степени консервативности доменов между полимеразами семейства Y некоторые структурные особенности, наблюдаемые в Pol 9Комплекс 0361 K -ДНК-PCNA, вероятно, применим к другим полимеразным комплексам TLS.
«Понимая взаимодействия между белками, образующими эти комплексы, и то, как они регулируются, мы можем найти способы уменьшить или увеличить их функцию для медицинских приложений», — заключает он.
Узнать больше
Соединение структуры пояса инструментов для репликации ДНК
Дополнительная информация:
Claudia Lancey et al, Крио-ЭМ-структура Pol κ человека, связанного с ДНК и моноубиквитилированного PCNA, Nature Communications (2021). DOI: 10.1038/s41467-021-26251-6
Информация журнала:
Связь с природой
Предоставлено
Университет науки и технологий короля Абдаллы
Цитата :
Репликация ДНК под микроскопом (2021, 22 ноября)
получено 3 октября 2022 г.
с https://phys.org/news/2021-11-dna-replication-microscope.html
Этот документ защищен авторским правом. Помимо любой добросовестной сделки с целью частного изучения или исследования, никакие
часть может быть воспроизведена без письменного разрешения. Контент предоставляется только в ознакомительных целях.
ДНК человека под микроскопом | Поиск в TikTok
TikTok
Загрузить
Для вас
Читать
alexdainis
Alex Dainis 🧬🔬
Взяв новый микроскоп за щеку 3 #0 #днк #биология #scienceforkids #stem
217,1 тыс. лайков, 1,4 тыс. комментариев. Видео TikTok от Алекса Дайниса 🧬🔬 (@alexdainis): «Проверяем новый #микроскоп, глядя на клетки щеки! #днк #биология #наукадлядетей #стебель». Давайте посмотрим на мою ДНК! | Мы возьмем «сотовый» — тьфу. Я знаю. | Итак, у нас есть слайд, и мы собираемся добавить пару капель воды. | …. оригинальный звук.
1,2 млн просмотров|
original sound — Alex Dainis 🧬🔬
Justice.dodson
Justice Dodson
Ответить на @the_silent_weeb Отдельные нити слишком малы, чтобы их можно было разглядеть, но вы можете наблюдать скопления ДНК (для вас #
3 # 3 голубым цветом) 3 #микроскоп #наука #днк
3,8 тыс. лайков, 34 комментария. Видео TikTok от Джастиса Додсона (@justice.dodson): «Ответ @the_silent_weeb Отдельные нити слишком малы, чтобы их можно было увидеть, но вы можете наблюдать глыбы ДНК (синим цветом) #foryou #microscope #science #dna». Средство для мытья посуды | Размягчитель мяса | Алкоголь | …. Она делится историей (для видеоблога).
53,7 тыс. просмотров|
She Share Story (для Vlog) — 山口夕依
генетическая лаборатория
Лаборатория генетики
Ответьте на @amaant_ по запросу. #DNA #MICROSCOPE #EDUTOK #LABTOK #Learnontiktok #ResponseVideo #science # -rosponsevideo #cess . . . . . # -rosponsevideo #science # -rosponsevideo . Видео TikTok от Genetics Lab (@geneticslab): «Ответьте на @amaant_ в соответствии с запросом. #dna #microscope #edutok #labtok #learnontiktok #responsevideo #science #xy». 4-кратное увеличение | 10-кратное увеличение | 20-кратное увеличение | …. Начинаю.
174,4 тыс. просмотров|
Beggin’ — Måneskin
justice.
dodson
Justice Dodson
You guys asked for DNA so there you go 🧬🔬 @auraespera #fyp #foryoupage #science #microscope # xyzbca #zyxcba
76,9 тыс. лайков, 525 комментариев. Видео TikTok от Джастиса Додсона (@justice.dodson): «Ребята, вы просили ДНК, так что вот 🧬🔬 @auraespera #fyp #foryoupage #science #microscope #xyzbca #zyxcba». Только используя эти предметы | 🧬Я собираюсь извлечь свою ДНК 🧬 | Соленая вода | …. Воспоминания (Напитки возвращают).
418,7 тыс. просмотров|
Воспоминания (напитки возвращают) — Ajay Stephens
Justice.dodson
Двук Додсон
Ответ на @Vintage_RocketLeague Даже на 1000x Двойной спираль слишком маленький, #FORY, , , , , , , , # # # # # # # #. #velabco #science #DontSpillChallenge
14,3 тыс. лайков, 96 комментариев. Видео TikTok от Джастиса Додсона (@justice.dodson): «Ответ @vintage_rocketleague Даже при увеличении в 1000 раз двойная спираль слишком мала, чтобы ее можно было увидеть 🧬 #foryou #microscope #velabco #science #DontSpillChallenge». ДНК клубники | 40x | 100x | …. Interstellar- основная тема.
265,2 тыс. просмотров|
Interstellar- Main Theme — Geek Music
pleiadianmom
ThereIsReallyOnlyOneOfUsHere
The #floweriife is within you #dna #microscope #seedoflife #sacredgeometry
TikTok video from ThereIsReallyOnlyOneOfUsHere (@pleiadianmom ): «#floweriife находится внутри вас #днк #микроскоп #seedoflife #sacredgeometry». Знаете ли вы, что это поперечное сечение ДНК под микроскопом? Роган Тай.
321 просмотр|
Rogan Tay — White Sun
больше экстрагуапожалуйста
Hannah Benfield
Душевный опыт был похож на ультразвук. 😌🥰 #fyp #bloodcells #medicalstuff #amazing #humancells #dna #sciencetok #educate #foryoupage
TikTok video from Hannah Benfield (@moreextraguacplease): «Душевное переживание было похоже на УЗИ. Время, когда я должен смотреть
в моей крови 🩸
клетки крупным планом
под
микроскоп 🔬 | Один из моих очень близких

друзья взяли меня сделать
это | Она сказала мне, что они выступали на экране в музыкальной манере, и она не видела этого раньше | …. 《钢琴与弦乐》雨后香气.
1085 просмотров|
《钢琴与弦乐》雨后香气 — 没有发光的金
jasonwisti
Jason Wisti
#microscope #microscopezoom #microscopechallenge #curiosity #DNA #blood
Видео TikTok от Джейсона Висти (@jasonwisti): «#микроскоп #микроскопзум #микроскопвызов #любопытство #ДНК #кровь». ДНК под микроскопом. Вечеринка у бассейна.
7534 просмотра|
Вечеринка у бассейна — Duo Dynamic
SOCADOKA
@⃝꙰⃝꙰⃝꙰⃝꙰⃝꙰⃝꙰⃝꙰⃝꙰⃝꙰⃝
#DNA #MICROSCOPIC #FYP #FYP
TIKTOK VIELES с @@sosocadna) (@SOCADNA). Ближайшие люди могут видеть ДНК | Вы знали? ДНК может растягиваться до тех пор, пока не достигнет Солнца и обратно 4 раза или от Земли до Луны 1500 раз. оригинальный звук.
336 просмотров|
оригинальный звук — @⃝꙰⃝꙰⃝꙰⃝꙰⃝꙰⃝꙰⃝꙰⃝꙰⃝꙰⃝
red.side
КРАСНАЯ СТОРОНА | 3D
#viral #foryou #fyp #fypシ #microscope
677,7 тыс. лайков, 3,2 тыс. комментариев. Видео TikTok от RED SIDE | 3D (@red. side): «#viral #foryou #fyp #fypシ #microscope». Тело человека под электронным микроскопом. Ремикс Super Smash Bros Brawl Drill.
4,4 млн просмотров|
Super Smash Bros Brawl Drill Remix — Shae OT
Усовершенствованная микроскопия выявила необычную структуру ДНК – LabNews
ВИДЕНИЕ ВЫТЯЖЕННОЙ ДНК — Специалист по оптике Sandia Адам Бэкер помог разработать передовую технику микроскопии, которая выявила сильно наклоненные пары оснований в растянутой форме ДНК.
Усовершенствованный метод визуализации позволяет выявить новые структурные детали S-ДНК, похожей на лестницу ДНК, которая формируется, когда молекула испытывает сильное напряжение. Эта работа, проведенная в Университете Сандия и Врие в Нидерландах, дает первое экспериментальное свидетельство того, что S-ДНК содержит сильно наклоненные пары оснований.
Предсказуемое спаривание и расположение пар оснований ДНК помогает определить форму двойной спирали молекулы. Понимание того, как перестраиваются пары оснований при растяжении ДНК, может дать представление о ряде биологических процессов и улучшить дизайн и производительность наноустройств, построенных с использованием ДНК. Согласно недавней статье в Science Advances, наклонные пары оснований в растянутой S-ДНК были предсказаны ранее с помощью компьютерного моделирования, но до сих пор никогда не демонстрировались убедительно в экспериментах.
ДНК наиболее известна как молекулярный носитель генетической информации. Однако в исследовательских лабораториях по всему миру у него есть и другое применение: строительный материал для наноразмерных устройств. Для этого ученые подготавливают сгенерированные компьютером последовательности одноцепочечной ДНК, чтобы определенные участки образовывали пары оснований с другими участками. Это заставляет прядь сгибаться и складываться, как оригами. Исследователи использовали этот принцип для складывания ДНК в микроскопические смайлики, наномашины с подвижными шарнирами и поршнями и «умные» материалы, которые спонтанно приспосабливаются к изменениям в окружающей химической среде.
«Чтобы построить самолет или мост, важно знать структуру, прочность и эластичность каждого материала, из которого они сделаны», — сказал Адам Бэкер, ученый-оптик Sandia и ведущий автор исследования. «То же самое верно и при разработке наноструктур с ДНК».
Хотя многое известно о механических свойствах двойной спирали ДНК, остаются загадками детали ее формы, когда молекула растягивается в лаборатории для формирования лестничной структуры S-ДНК. Стандартные способы визуализации структуры ДНК не могут отследить структурные изменения, пока молекула раскручивается.
Манипулирование микроскопическими частицами
Чтобы охарактеризовать структуру и растяжимость S-ДНК, Адам работал с коллегами из исследовательской группы «Физика живых систем» в LaserLaB Amsterdam в Университете Врие. Адам и его соавторы, Андреас Бибрихер, Грэм Кинг, Иддо Хеллер, Гийс Вуйте и Эрвин Петерман, описали свой процесс в журнальной статье.
Используя инструменты, разработанные его коллегами, Адам сначала прикрепил микроскопические шарики к каждому концу короткого фрагмента вирусной ДНК. Эти шарики служили ручками для манипулирования одной молекулой ДНК.
Затем исследователи захватили ДНК из бусинок в узкой, заполненной жидкостью камере, используя два точно сфокусированных лазерных луча. Поскольку шарики остаются в ловушке внутри лазерных лучей, исследователи могли перемещать шарики в камере, перенаправляя лучи. Это позволило им растянуть прикрепленную ДНК, чтобы сформировать S-ДНК.
Этот метод манипулирования микроскопическими частицами, называемый оптическим пинцетом, также обеспечивал точный контроль над величиной силы растяжения, прикладываемой к отдельной молекуле ДНК. Однако структурные изменения, происходящие внутри растянутой молекулы ДНК, были слишком малы, чтобы их можно было непосредственно наблюдать с помощью стандартного оптического микроскопа.
Флуоресцентная поляризационная микроскопия
Чтобы решить эту проблему, Адам помог своим коллегам объединить метод визуализации, называемый флуоресцентной поляризационной микроскопией, с оптическим пинцетом. Во-первых, они добавили маленькие палочковидные молекулы флуоресцентного красителя в раствор, содержащий оптически захваченную ДНК. В нерастянутой ДНК молекулы красителя располагаются между соседними наборами пар оснований и выстраиваются перпендикулярно центральной оси двойной спирали. Если сила растяжения заставляет пары оснований ДНК наклоняться, красители также будут наклоняться.
Затем исследователи использовали флуоресцентные сигналы от красителей, чтобы определить, наклонены ли пары оснований в растянутой ДНК. Красители излучают зеленый флуоресцентный свет, когда они взаимодействуют со световыми волнами от лазерного луча, направленного вдоль той же оси, что и молекулы красителя.
Исследователи изменили ориентацию световых волн, поворачивая поляризацию лазерного луча под разными углами. Затем они растянули ДНК и наблюдали за появлением зеленых флуоресцентных сигналов под микроскопом. Из этих измерений и методов вычислительного анализа, разработанных в Sandia, исследователи определили, что красители и, следовательно, пары оснований выровнены под углом 54 градуса относительно центральной оси ДНК.
«Этот эксперимент предоставляет самые прямые доказательства на сегодняшний день, подтверждающие гипотезу о том, что S-ДНК содержит наклоненные пары оснований», — сказал Адам. «Чтобы получить это принципиально новое понимание ДНК, необходимо было объединить ряд передовых технологий и объединить ученых из различных технических дисциплин для работы над достижением общей цели».
Физические принципы деформации ДНК
Среди ученых широко распространено предположение, что структуры, напоминающие S-ДНК, могут образовываться в ходе повседневной деятельности клеток человека, но в настоящее время биологическое назначение S-ДНК до сих пор неизвестно. S-ДНК может способствовать восстановлению поврежденной или сломанной ДНК, помогая защититься от гибели клеток и рака. Адам надеется, что это более четкое понимание физических принципов, регулирующих деформацию ДНК, поможет в дальнейших исследованиях роли S-ДНК в клетках.
Когда Адам присоединился к Лаборатории в качестве стипендиата Трумэна в ноябре 2016 года, у него была возможность начать независимую исследовательскую программу по собственному проекту. Он разработал метод поляризационной микроскопии в аспирантуре Стэнфордского университета и считал, что у этой техники есть потенциал.
«В Sandia я хотел продвинуть эту технику как можно дальше, — сказал он. «Тот факт, что эта работа привела к результатам, имеющим потенциальное отношение к таким областям, как биология и нанотехнологии, является экстраординарным».
Лаборатория выделения ДНК клубники для детей
Задумывались ли ваши дети, почему их волосы одного цвета, а волосы их друзей — другого? Или почему у собак волосатые, а у птиц перья? Все это закодировано в самых фундаментальных чертежах живого существа… в нашей ДНК. Сегодня мы проводим кухонный научный эксперимент, который позволяет нам увидеть ДНК!
Лаборатория экстракции ДНК клубники
Кухонная научная лаборатория для детей
Крупный план ДНК клубники, все еще находящейся в экстракционной жидкости.
Отказ от ответственности: эта статья может содержать комиссионные или партнерские ссылки. Как партнер Amazon я зарабатываю на соответствующих покупках.
Не видите наши видео? Отключите все блокировщики рекламы, чтобы наш видеопоток был виден. Или посетите наш канал на YouTube, чтобы узнать, загружено ли туда видео. Мы потихоньку загружаем наши архивы. Спасибо!
Большинство детей слышали о ДНК. Если они прошли стадию динозавров, похоже, что ДНК является естественной частью изучения всего о динозаврах. Но знаете ли вы, что можете сделать простую кухонную лабораторию и держать ДНК в руках (ну, пинцет)?
Этот эксперимент представляет собой невероятную биологическую лабораторию для учащихся старших классов и старшей школы.
Посмотрите видео этого эксперимента! Если вы не видите видео, отключите блокировщики рекламы, так как они также блокируют наш видеопоток. Или вы можете найти это видео и многие другие на канале STEAM Powered Family на YouTube. Спасибо!
Что такое ДНК?
Хорошо, наши дети, возможно, слышали о ДНК, но знают ли они, что это такое? Давайте сначала разберемся с терминологией и пояснениями.
ДНК означает дезоксирибонуклеиновую кислоту , она содержится в клетках всех живых организмов и в основном является инструкциями или чертежами для нашего тела. Каждая клетка имеет полную копию этих инструкций в своем ядре.
Ученые изучают ДНК, потому что это как учебник для организма. ДНК — это наш генетический код. Он наполнен информацией, которая контролирует внешний вид и функции организма. Когда они изучают ДНК, они могут узнать о вымерших видах (например, о динозаврах), они могут создавать вакцины и лекарства, они могут использовать ДНК для раскрытия преступлений и многое другое. Изучение ДНК используется учеными всего мира по-разному.
ДНК представляет собой двойную спираль с двумя нитями, химически связанными наподобие спиралевидной лестницы. Он живет в ядре клетки в парах, называемых хромосомами. У человека 46 хромосом, расположенных в 23 парах.
ДНК была открыта в 1869 году Фридрихом Мишером, но открытие Мишера было только началом. Только в 1940-х годах ученые начали понимать, как ДНК связана с наследственными признаками. По сей день ученые во всем мире постоянно работают над раскрытием секретов, скрытых в коде ДНК наших клеток.
Почему клубника используется для выделения ДНК?
Есть несколько веских причин, по которым клубника является идеальным экспериментом по извлечению ДНК для студенческой лаборатории.
- Клубника легко доступна в большинстве мест в мире.
- Детям легко измельчить их руками.
- Клубника содержит ферменты пектиназы и целлюлазы, которые помогают разрушать клеточные стенки, что способствует высвобождению драгоценной ДНК.
- клубника октоплоид . Это означает, что у них есть восемь копий каждого типа ДНК-хромосомы. Клетки человека диплоидны, то есть имеют два набора хромосом. Это означает, что из клубники можно извлечь МНОГО дополнительной ДНК, что приведет к более высоким показателям успеваемости учащихся.
Тем не менее, как только ваши ученики освоят выделение ДНК из клубники, почему бы не бросить им вызов, чтобы узнать, смогут ли они извлечь ДНК из других фруктов? Бананы, киви и даже овсянка — отличные варианты!
Как извлечь ДНК из клубники
Теперь, когда мы много говорили о ДНК и клубнике, давайте начнем нашу лабораторию по извлечению ДНК.
Принадлежности и материалы
Спелая клубника (немного перезрелая – еще лучше!) Если вы используете замороженную, убедитесь, что она полностью оттаяла.
Закрывающийся пластиковый пакет (лучше всего подойдут более толстые пакеты для заморозки)
Средство для мытья посуды (мы использовали прозрачное, чтобы цвет не влиял на внешний вид, но подойдет любой)
Salt (table salt – NaCl)
Water
Isopropyl alcohol (rubbing alcohol will work too)
Coffee filter or paper towel
Clear cups or test tubes
Tweezers or a chop stick подойдет
Шприц, мерные стаканчики, мерные ложки (все, что у вас есть, подойдет!)
Бумажные полотенца (для очистки)
Необязательно, но настоятельно рекомендуется:
Микроскоп и принадлежности для изготовления предметных стекол
Увеличительное стекло тоже подойдет, если у вас нет микроскопа.
Инструкции по извлечению ДНК
Поместите спирт в морозильную камеру как минимум на час. Ты хочешь холода.
Создание жидкости для выделения ДНК. В одной чашке смешайте 60 мл (1/4 чашки) воды (комнатной температуры) с 1 столовой ложкой средства для мытья посуды и 1 чайной ложкой соли. Аккуратно перемешайте (вы не хотите, чтобы образовались пузыри).
Удалите зелень с клубники, поместите две в полиэтиленовый пакет и плотно завяжите его. Тогда приступайте к затиранию! Вы хотите размять его полностью, пока не будет комочков. Используйте пальцы и ладони, чтобы размять его. Не используйте никаких инструментов, так как они могут разорвать сумку, к тому же это больше понравится детям!
После получения пюре добавьте 20 мл экстракционной жидкости. Помассируйте еще одну минуту.
Добавьте кофейный фильтр в чистую чашку. Вдавите его в чашку, чтобы раздавленную клубнику можно было высыпать, не переливая через край.
Налейте пюре из клубники в фильтр так, чтобы в чашку попадала только жидкость. Вы можете ОЧЕНЬ ОСТОРОЖНО поднять и сжать фильтр, если вам нужно получить немного больше жидкости. Будьте очень осторожны, чтобы не разорвать фильтр. Вы не хотите, чтобы какие-либо твердые вещества попадали в стакан, только жидкость.
Если вы обнаружите, что фильтр для кофе вам не подходит, попробуйте поместить фильтр для кофе в воронку или использовать марлю вместо фильтра для кофе. Марля не порвется.
Налейте в чашку около столовой ложки холодного изопропилового спирта. Наклоните чашку так, чтобы она скользила вниз по стенке стакана.
Смотрите, как нити ДНК отделяются от красной клубничной жидкости!
ДНК клубники осаждалась в экстракционном буфере.
Используйте свой пинцет или палочку для еды, чтобы достать ДНК, чтобы вы могли изучить ее.
Как выглядит ДНК клубники?
Вместо того, чтобы объяснять… вот картинка!
ДНК клубники сразу после извлечения из жидкости. Похоже на сопли! ДНК клубники
будет выглядеть как вязкое белое вещество. Как говорят мои дети, «похоже на сопли!»
Но если вы осторожно растянете его, вы сможете увидеть больше деталей этих нитей ДНК.
Крупный план ДНК клубники на предметном стекле, сделанный с помощью макрообъектива.
Нам очень понравилось пользоваться увеличительным стеклом. Затем мы создали слайд с ДНК нашей клубники и рассмотрели его под микроскопом. Если вы делаете слайды, убедитесь, что вы растянули их как по длине, так и по ширине, чтобы вы могли действительно разглядеть все детали под микроскопом.
Как работает экстракция ДНК клубники?
В этой научной лаборатории все работает вместе, чтобы идеально выделить ДНК клубники. Вот что делает каждый элемент.
Средство для мытья посуды помогает растворить клеточную мембрану, которая представляет собой липидный (жировой) слой.
Соль (хлорид натрия NaCl) помогает удалить белковые цепи, связывающие ДНК. Это также помогает удерживать белки в жидкости, чтобы они не осаждались в спирте вместе с ДНК.
Изопропиловый спирт вызывает осаждение ДНК (затвердевание), поскольку ДНК не растворяется в спирте, особенно в холодном спирте.
Зачем экстрагировать ДНК клубники?
Это невероятная лаборатория биологических наук, которую можно делать со своими учениками. ДНК обычно является чем-то, что мы не можем увидеть или наблюдать, что затрудняет понимание и оценку детей. С помощью этого эксперимента мы даем учащимся возможность поработать с ДНК и сделать эту важную часть всех форм жизни более осязаемой концепцией.
Этот невероятный эксперимент студенты никогда не забудут!
Далее в ваших исследованиях ДНК создайте модель ДНК
Заинтересованы в проведении дополнительных лабораторий по биологии?
Узнайте больше о клетках и клеточной структуре в нашем эксперименте с голыми яйцеклетками.
Ознакомьтесь с нашим невероятным исследованием сердца, включая создание модели бьющегося сердца.
Студент изучает ДНК клубники в микроскоп
More Discovery Labs
«Микроскопия ДНК» предлагает совершенно новый способ визуализации клеток — ScienceDaily
Традиционно ученые использовали свет, рентгеновские лучи и электроны, чтобы заглянуть внутрь тканей и клеток. Сегодня ученые могут проследить нитевидные волокна нервов по всему мозгу и даже наблюдать, как живые эмбрионы мышей вызывают в воображении бьющиеся клетки рудиментарного сердца.
Но есть одна вещь, которую эти микроскопы не видят: что происходит в клетках на геномном уровне.
Теперь биофизик Джошуа Вайнштейн и его коллеги изобрели неортодоксальный тип визуализации, получивший название «ДНК-микроскопия», который может сделать именно это. Вместо того, чтобы полагаться на свет (или вообще на какую-либо оптику), команда использует «штрих-коды» ДНК, чтобы помочь определить относительное положение молекул в образце.
С помощью микроскопии ДНК ученые могут построить картину клеток и одновременно собрать огромное количество геномной информации, говорит Вайнштейн. «Это дает нам еще один слой биологии, который мы не смогли увидеть».
Вайнштейн, исследователь Медицинского института Говарда Хьюза (HHMI) Авив Регев и молекулярный биолог Фэн Чжан, который был выбран в качестве исследователя HHMI в 2018 году, сообщают о работе 20 июня 2019 года в журнале Cell .
реклама
«Это совершенно новая категория микроскопии, — говорит Регев. «Это не просто новая техника, это способ делать вещи, о которых мы раньше даже не думали».
Что-то новое
До сих пор микроскопию можно было разделить на две основные категории. Первый основан на оптике; световая микроскопия, например, восходит к 1600-м годам и полагается на видимый свет для освещения образцов. Ученые шутили над этим подходом, даже выходя за пределы видимого спектра. Электронные микроскопы, флуоресцентные микроскопы, световые микроскопы — все они основаны на том принципе, что образцы испускают фотоны или электроны, а микроскоп регистрирует это излучение.
Вторая категория основана на препарировании образцов в местах, определяемых микроскопом. Затем компьютерные программы сшивают каждый рассеченный фрагмент в полную картину неповрежденного образца. Оптическое изображение может предложить сложные портреты субклеточной структуры и действия. Микроскопия на основе вскрытия может дать ученым генетическую информацию.
Вайнштейн и его коллеги из Массачусетского технологического института хотели создать способ сделать все это одним махом — сделать снимок положения клетки и описать конкретные генетические последовательности, управляющие ею.
Эта комбинация важна для ученых, изучающих генетически разнообразные наборы клеток. Иммунная система является прекрасным примером, говорит Вайнштейн. Гены иммунных клеток могут варьироваться до одной буквы ДНК. Каждая вариация может вызвать резкое изменение типа антител, вырабатываемых клеткой. Расположение этой клетки в ткани также может изменить выработку антител.
Если вы сосредоточитесь только на одном или другом, «вы получите только часть картины», — говорит он.
Как это работает
По словам Регева, для получения такой полной картины клетки не требуется дорогой микроскоп или много сложного оборудования. Все, что вам нужно для начала, это образец и пипетка.
Сначала ученые берут клетки, выращенные в лаборатории, и помещают их в реакционную камеру. Затем они добавляют набор штрих-кодов ДНК. Они прилипают к молекулам РНК, придавая каждой уникальной метке. Затем команда использует химическую реакцию, чтобы сделать все больше и больше копий каждой помеченной молекулы — растущая куча, которая расширяется от исходного местоположения каждой молекулы.
«Представьте себе каждую молекулу в виде радиовышки, передающей собственный сигнал наружу», — говорит Вайнштейн.
В конце концов, меченые молекулы сталкиваются с другими мечеными молекулами, заставляя их соединяться в пары. Молекулы, расположенные близко друг к другу, с большей вероятностью будут сталкиваться, создавая больше пар ДНК. Молекулы, расположенные дальше друг от друга, будут генерировать меньше пар.
Машина для секвенирования ДНК расшифровывает буквы каждой молекулы в образце, что занимает до 30 часов. Алгоритм, созданный командой, затем декодирует данные, которые в статье представляют примерно 50 миллионов букв ДНК генетических последовательностей из каждого исходного образца, и преобразует необработанные данные в изображения.
«В принципе, вы можете точно воссоздать то, что видите под световым микроскопом, — говорит Вайнштейн.
Эти два метода дополняют друг друга, добавляет он. Световая микроскопия может хорошо видеть молекулы, даже если они разрежены в образце, а ДНК-микроскопия превосходна, когда молекулы плотные — даже нагроможденные друг на друга.
Он считает, что микроскопия ДНК однажды позволит ученым ускорить разработку методов иммунотерапии, помогающих иммунной системе пациентов бороться с раком. По его словам, этот метод потенциально может идентифицировать иммунные клетки, которые лучше всего подходят для борьбы с конкретной раковой клеткой.