Содержание
Петли на ДНК защитили клетки от мутаций — Cells — Поиск
Российские ученые определили структуру петель, образующихся на ДНК во время считывания генов, и выяснили, что они позволяют клетке найти и обезвредить разрывы в нуклеотидных цепях. Понимание механизмов, защищающих клетку от повреждения наследственного материала, может оказаться полезным для разработки лекарств от тяжелых заболеваний, в том числе рака. Результаты исследования, поддержанного грантом Российского научного фонда (РНФ), опубликованы в журнале Cells.
Молекула ДНК состоит из двух цепей. Под действием неблагоприятных внешних воздействий, например ультрафиолета или канцерогенных веществ, одна из цепей может разорваться. Кроме того, в норме брешь в цепи образуется при клеточном делении, когда ДНК копируется. Ежедневно в клетках человека под действием внешних воздействий и внутренних процессов происходит от десяти до ста тысяч таких разрывов. Большая их часть исправляется с помощью специальных белков — так называемой системы репарации, которая помогает «залатать» бреши в молекуле ДНК. Для функционирования клетки важно, чтобы подобные одноцепочечные разрывы были вовремя устранены, иначе могут произойти и двухцепочечные разрывы. Они приводят к встраиванию или выпадению небольших фрагментов последовательности, то есть вызывают мутации. Это чревато либо гибелью клетки, либо провоцирует ее злокачественное перерождение.
Клетка распознает некоторые одноцепочечные разрывы с помощью ферментов, двигающихся вдоль нити ДНК. Например, во время транскрипции, то есть считывания генетического материала, фермент РНК-полимераза «ползет» вдоль одной из цепей ДНК и синтезирует РНК — молекулу, на которой потом рибосомы собирают белок. Известно, что, если на ДНК встречается одноцепочечный разрыв, продвижение РНК-полимеразы прекращается. Застопорившийся фермент служит указателем на ошибку — он привлекает систему репарации, которая ее исправляет. Однако РНК-полимераза всегда двигается только по одной из двух нитей ДНК — той, которая кодирует ген (она называется смысловой). Вторая цепь — антисмысловая — не кодирует гены, а служит только для копирования молекулы ДНК в ходе деления клетки. Долгое время оставался необъяснимым вопрос — как же система репарации может узнать разрыв на второй цепи ДНК, если РНК-полимераза ее не считывает.
Ученые из Московского государственного университета имени М. В. Ломоносова (Москва) и Института биоорганической химии имени академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН (Москва) совместно с коллегами из Университета МГУ-ППИ в Шэньчжэне (Китай), Медицинской школы Рутгерса Роберта Вуда Джонсона (США) и центра исследования рака Фокс Чейз (США) выяснили, как клетка находит одноцепочечные разрывы на антисмысловой цепи ДНК. Для этого авторы с помощью электронной микроскопии, биохимических методов и молекулярного моделирования изучили укладку нуклеиновой кислоты в месте, где происходит считывание генетической информации. В этой области образуются особые петли длиной 55 пар нуклеотидов (элементарных звеньев нуклеиновой цепочки), располагающиеся между нуклеосомой (белковой структурой, на которую намотана ДНК) и РНК-полимеразой. Исследовав структуру этих петель, ученые выяснили, что их геометрия сильно изменяется, если в антисмысловой цепи ДНК есть одноцепочечный разрыв — в этом случае уменьшается расстояние между нуклеосомой и РНК-полимеразой.
Полученные данные легли в основу модели, объясняющей, каким образом клетка обнаруживает разрыв на антисмысловой цепи и блокирует движение РНК-полимеразы вдоль нити ДНК. Согласно этой модели, когда фермент перемещается по цепи ДНК, позади и впереди нее формируются петли; в норме они должны открываться, чтобы обеспечить дальнейшее продвижение РНК-полимеразы вдоль цепи. Если в антисмысловой цепи ДНК за ферментом находится одноцепочечный разрыв, петля оперативно закрывается, что может вызывать остановку движения полимеразы. Таким образом, петли служат сенсорами разрывов в антисмысловой цепи. Благодаря этому в клетках предотвращается считывание поврежденных участков генов и начинается процесс исправления ошибок с помощью системы репарации.
«Мы открыли новый механизм, с помощью которого клетка может находить разрывы в ДНК, — рассказывает Ольга Соколова, доктор биологических наук, профессор биологического факультета МГУ, профессор РАН. — Понимание этого механизма имеет большое значение для фундаментальной науки: повреждение ДНК ведет к накоплению мутаций, и, как следствие, смерти или нарушению работы клетки. Это способствует развитию различных заболеваний, в том числе онкологических и нейродегенеративных».
Выявление ранее неизвестного механизма того, как обнаруживаются разрывы в ДНК, открывает новые перспективы для разработки методов лечения, которые предполагают повышение стабильности ДНК-петель. С другой стороны, оно может послужить отправной точкой для создания терапевтических препаратов, нацеленных на снижение стабильности петель ДНК. Такие вещества могли бы лечь в основу создания лекарственных средств, вызывающих программируемую смерть раковых клеток или клеток, пораженных вирусами.
Рисунок 1. А. Электронно-микроскопические изображения комплексов РНК-полимеразы с нуклеосомой. В случае двухцепочечного разрыва (снизу) расстояние между нуклеосомой и РНК-полимеразой оказывается существенно меньше, чем в случае неповрежденной ДНК (сверху). B. Диаграмма, показывающая расстояние между нуклеосомой и РНК-полимеразой для случая поврежденной (слева) и целой (справа) ДНК. C и D. 3D-модели петли, образующейся при считывании гена для ДНК без разрыва (слева) и ДНК, содержащей разрыв на одной из цепей (справа). Источник: Gerasimova et al. / Cells, 2022
Рисунок 2. Механизм, объясняющий блокировку движения РНК-полимеразы вдоль цепи ДНК в случае одноцепочечного разрыва. Более компактная петля, образующаяся в случае одноцепочечного разрыва (справа), приводит к остановке РНК-полимеразы. Источник: Gerasimova et al. / Cells, 2022
Пресс-служба Российского научного фонда
ДНК как флешка: зачем записывать цифровые данные в геном
https://ria.ru/20180302/1515449180.html
ДНК как флешка: зачем записывать цифровые данные в геном
ДНК как флешка: зачем записывать цифровые данные в геном — РИА Новости, 02.03.2018
ДНК как флешка: зачем записывать цифровые данные в геном
Рост объема цифровой информации побуждает ученых искать более компактные способы ее записи и хранения. А что может быть компактнее ДНК? РИА Новости вместе с… РИА Новости, 02.03.2018
2018-03-02T08:00
2018-03-02T08:00
2018-03-02T11:05
/html/head/meta[@name=’og:title’]/@content
/html/head/meta[@name=’og:description’]/@content
https://cdnn21.img.ria.ru/images/151544/77/1515447780_0:3:1036:586_1920x0_80_0_0_cb9e256ddec0f9492a08dc5046060d04.jpg
РИА Новости
1
5
4.7
96
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/
2018
РИА Новости
1
5
4.7
96
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/
Новости
ru-RU
https://ria.ru/docs/about/copyright.html
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/
РИА Новости
1
5
4.7
96
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og. xn--p1ai/awards/
1920
1080
true
1920
1440
true
https://cdnn21.img.ria.ru/images/151544/77/1515447780_127:0:911:588_1920x0_80_0_0_52549291f86daae6981d5c0ad3758425.jpg
1920
1920
true
РИА Новости
1
5
4.7
96
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/
РИА Новости
1
5
4.7
96
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/
МОСКВА, 2 мар — РИА Новости. Рост объема цифровой информации побуждает ученых искать более компактные способы ее записи и хранения. А что может быть компактнее ДНК? РИА Новости вместе с экспертом выяснило, как закодировать слова нуклеотидами и сколько данных вмещает одна молекула.
Основания-коды
ДНК представляет собой последовательность нуклеотидов. Их всего четыре: аденин, гуанин, тимин, цитозин. Для кодирования информации каждому из них приписывают цифру-код. Например, тимин — 0, гуанин — 1, аденин — 2, цитозин —3. Кодирование начинается с того, что все буквы, цифры и изображения переводят в двоичный код, то есть последовательность нулей и единиц, а их уже — в последовательность нуклеотидов, то есть четверичный код.
© Иллюстрация РИА Новости . Алина ПолянинаПрежде чем закодировать данные в ДНК, нужно перевести их в цифровой код
© Иллюстрация РИА Новости . Алина Полянина
Можно применять только три нуклеотида для постройки кода (троичный код), а четвертым — разбивать последовательности на части. Есть вариант с построением оснований в виде двоичного кода, когда два из них соответствуют нулю, а два — единице.
Для считывания применяют несколько методик. Одна из самых распространенных заключается в том, что цепочку молекулы ДНК копируют с помощью оснований, у каждого из которых есть цветовая метка. Затем очень чувствительный детектор считывает данные, и по цветам компьютер восстанавливает последовательность нуклеотидов.
«Молекула ДНК очень емкая. Даже у бактерии она, как правило, содержит около миллиона оснований, а у человека — целых три миллиарда. То есть каждая клетка человека несет объем информации, сопоставимый с вместимостью флешки. И таких клеток у нас триллионы. В ДНК можно записать огромное количество данных, но запись и чтение с такого носителя пока происходят слишком медленно и дорого стоят», — рассказывает Александр Панчин, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник Института проблем передачи информации имени А. А. Харкевича РАН.
7 февраля 2018, 08:00Наука
Любительские биотехнологии: как побороть старость и взломать ДНК
Плотность записи растет
В июне 1999 года в журнале Nature вышла статья американских ученых, разработавших технику отправки секретных сообщений с помощью ДНК. Они синтезировали молекулу, включив в нее последовательность нуклеотидов, сформированную с использованием четверичного кода. Секретную ДНК в составе смеси отправили в другую лабораторию. Ее сотрудники, используя особые химические ключи, нашли нужную молекулу и извлекли из нее информацию.
«Вообще, есть два подхода к записи данных на ДНК. Первый, когда вы синтезируете совершенно новую ДНК, используя химический синтезатор. По команде компьютера нуклеотиды добавляются в раствор в определенном порядке, и постепенно «вырастает» нужная цепочка оснований. Во втором случае кодируются данные в уже существующей ДНК какого-то организма», — поясняет Панчин.
В мае 2010 года группа Крейга Вентера, который первым составил карту генома человека, опубликовала работу о создании искусственной бактерии. Они взяли за основу очищенную от генома бактериальную клетку и поместили туда сформированную последовательность оснований. Получилась новая бактерия, вполне деятельная и живая, отличающаяся от обычной только тем, что ее ДНК создали вручную. Кроме того, коллектив продемонстрировал чувство прекрасного, записав с помощью четверичного кода в ДНК бактерии свои имена и цитаты из классических произведений.
26 декабря 2017, 17:47Наука
Первый реальный биохакер объяснил, зачем он поменял свою ДНК
В 2012 году группа под руководством молекулярного биолога Джорджа Чёрча подошла к делу более основательно и закодировала в ДНК книгу «Регенезис: как синтетическая биология заново откроет природу и нас самих» объемом в 52 тысячи слов, несколько картинок и одну программу, написанную на Java. Они применяли двоичный код. Общий объем данных составил 658 килобайт. Плотность информации оказалась равна почти 1018 байт на грамм молекул. Для сравнения: жесткий диск объемом 1012 байт весит около сотни граммов. Главный недостаток метода — нестабильность записанной информации.
«Молекула ДНК склонна мутировать, что понижает надежность хранения данных. Особенно если носитель ДНК — живая клетка, способная к делению: при удвоении ДНК ошибки закрадываются особенно часто. Надежность хранения данных повысится, если иметь тысячи копий одного и того же послания. Ну или просто хранить ДНК, скажем, в морозильнике. При низких температурах способность молекулы к мутации значительно снижается», — поясняет эксперт.
Кроме того, информация иногда теряется при чтении. Ошибки могут быть химического плана, когда к элементу присоединяется неправильное основание, так и чисто расчетными, то есть зависящими от компьютера.
Дорого, надежно
В марте 2017 года журнал Science опубликовал статью американских ученых, которым удалось записать 2*1017 байт на один грамм ДНК. Биологи подчеркивают, что не потеряли ни байта. Говоря проще, что записали, то и получили на выходе.
23 ноября 2017, 22:00
Ученые создали микроба-«шпиона», способного записывать информацию в ДНК
Для обычного пользователя «генетическая флешка» пока недоступна, потому что хранить информацию на ней очень дорого, а скорость чтения/записи — низкая. По оценкам ученых, считывание лишь одного мегабайта требует около трех с половиной тысяч долларов и нескольких часов времени.
К несомненным преимуществам записи информации на ДНК относится огромная плотность хранения данных, а также стабильность носителя — правда, лишь при низких температурах.
Что такое ДНК человека
IsTOPnik
Автор:
IsTOPnik
05 ноября 2020 09:06
Метки: ДНК человека видео днк интересно клетки фото человек
8957
5
1
ДНК, что это такое простыми словами, и как оно устроено? Физически это макромолекула, которая не только хранит в себе, какую-то наследственную информацию, но и является подробной инструкцией по развитию всего организма условно из одной универсальной клетки.
Источник:
Если сравнить человека с компьютером, а всё многообразие биологической жизни сравнить с различными формами роботизированных компьютеров, ДНК в этом сравнении будет биологическим языком программирования. С той лишь разницей, что биологические виды устроены намного сложнее и совершеннее самых передовых компьютеров.
К примеру, все биологические виды обладают уникальной способностью деления и преобразования клетки. Фактически, в ходе самовоспроизводства клетки, биомасса не только материализуется сама из себя, но и физически преобразовывается под решение множества узкоспециализированных задач. А всё многообразие живых видов, их форм, уникальных способностей исходит из деления одной универсальной клетки. Одно это уже уходит далеко за грань всех современных генетических достижений.
История открытия
Фактически открытие дезоксирибонуклеиновой кислоты произошло дважды. Первым открытие молекулы совершил Иоганн Фридрих Мишер в 1869 году. Будучи швейцарским биологом и физиологом, он из клеток, содержащихся в гное, смог выделить большую молекулу с высоким содержанием азота и фосфора. Свое открытие он назвал нуклеин, а позже нуклеиновой кислотой, когда были открыты её кислотные свойства.
Первоначально ученые считали, что основная функция нуклеиновой кислоты в хранении фосфора. А предположения, что она может содержать в себе наследственную информацию, вызывали насмешки, поскольку структура молекулы казалась им слишком простой и однообразной для таких функций. Так же считалось, что наличие дезоксирибонуклеиновой кислоты свойственно только животным клеткам, а в растениях содержится только РНК. Но, в 1934-1935 годах советские ученые-биологи А.Н. Белозерский и А.Р. Кезеля — это наглядно опровергли и опубликовали результаты своих работ в советских и мировых научных журналах.
Повторное открытие ДНК уже в качестве носителя наследственной информации и не только, было совершено в 1944 году. Группа исследователей, состоящая из Освальда Эвери, Колина Маклауда и Маклина Маккарти проводили эксперименты с трансформацией бактерий и доказали, что основную роль в этом процессе играет дезоксирибонуклеиновая кислота .
Значение ДНК в медицине
Источник:
Открытие ДНК в медицине, расшифровка этой кислоты – это события, которые трудно преувеличить. Большая часть современных прорывных технологий и исследований прямо или косвенно базируются на этом фундаментальном для науки открытии. Не знай мы про гены, не было бы многих современных методов лечения и диагностики, многих технических изобретений. По сути, не было бы и генетики, как полноценной самостоятельной науки. Застопорилось бы изучение клетки и того, как она функционирует. А без этих знаний и множество открытий в этой области были бы не возможны.
На сегодняшний день знания о генах помогают многим людям:
Узнать о заболевании намного раньше наступления первых симптомов. Лечение на сверхранней стадии всегда более успешно.
Найти своих близких и родных. Узнать много подробностей о своём роде.
Благодаря открытию носителя наследственной информации у медицины появился шанс побороть наследственные заболевания, которые ранее казались неизлечимыми.
Вполне возможно, что именно благодаря этому открытию человечество решит задачу многих тысячелетий и найдет эликсир бессмертия, или таблетку от всех болезней.
Молекула ДНК
ДНК определение, поиск его места в уже систематизированном знании не так прост. По существу к молекулам ДНК отнесли условно, для удобства. Молекула ДНК — это структура превосходящая размером обычные молекулы. И она имеет уникальную спиральную структуру. В то время, как физики и химики считают молекулами электрически нейтральные частицы, состоящие из одного и более атомов связанных ковалентными связями. Либо же, по результатам международного съезда химиков 1860, молекулой считается наименьшая частица вещества, обладающая всеми его химическими свойствами.
Структура ДНК
Источник:
У всех на слуху, что дезоксирибонуклеиновая кислота имеет двуспиральную структуру. В интернете, в фильмах, в рекламе – всюду можно встретить её многократно увеличенное изображение. Но, что ответить, если спросят «Объясните подробнее»? Это уже более сложный вопрос. Давайте разберемся лучше, из чего эта структура состоит:
Нуклеотиды — базовые структурные элементы.
Две цепочки генов, закрученные в спираль.
Каждая цепочка состоит из нуклеотидов, которые кодируют определенный ген.
Связывают две цепочки воедино водородные связи.
В цепочках нуклеотидов присутствуют и совсем не изученные структуры, которые с первого взгляда, ни как не участвуют в физиологических процессах. Эти, довольно обширные участки называют мусорными.
Состав ДНК
Если говорить о составе ДНК более подробно, то нуклеотиды это базовый структурный элемент, кирпичики из которых состоят обе цепи спирали. Нуклеотиды подразделяются на 4 разновидности: аденин, тимин, гуанин и цитозин. И всего 4 этих нуклеотида осуществляют запись всей наследственной информации и составляют все известные гены.
Закручиваются в спираль обе цепочки генов тоже не просто так. Из всех четырёх различных нуклеотидов находиться напротив друг друга в разных цепочках они могут только двумя парами: аденин-тимин и гуанин-цитозин. В науке эти пары называются комплементарными.
Между парными нуклеотидами возникает крепкая водородная связь. При этом, связь аденином и тимином немного слабее чем между гуанином и цитозином. Но закручиваются цепочки в спираль по иным причинам:
Исследования показали, что скручивание помогает сократить длину цепочки генов в 5-6 раз. А во время суперспирализации (такое тоже бывает) длина цепочки может сократиться в целых 30 раз!
Помимо того, что пара цепочек генов закручена в спираль, существует и суперспирализация. За это явление отвечают гистоновые белки, которые имеют форму катушек для ниток. Уже закрученная двойная спираль наматывается на эти белки, как нитка. Что не оставляет сомнений в том, что спиральность, как таковая специально служит тому, что бы более компактно упаковать наследственную информацию в клетку.
Роль в клетке
Конечно одна, даже большая двойная спираль не способна вместить в себя весь объем информации необходимый для такого сложного проекта, как человеческое тело. Возможно, поэтому эти цепочки объединены в пары, что делает их похожими на букву «Х». Хромосомы в свою очередь тоже парные, и их у человека 46 пар.
Помимо того, что хромосома содержит в себе подробную инструкцию по функционированию клетки, она же путем активации актуальных моменту генов, провоцирует клетку вырабатывать определённые белки с самыми различными свойствами. Например, в борьбе с опухолями активно участвует ген старости, который старит её недоброкачественнее клетки и не даёт им бесконечно делиться.
Источник:
Что такое нуклеотиды
Нуклеотиды это четыре элемента, которые являются основой биоязыка программирования цепи ДНК, так же, как ноль и единица являются основой ассемблера (первого из языков программирования). Уникальная последовательность нуклеотидов в одной из двух цепочек ДНК является геном. Если хотя бы немного изменить эту последовательность, то ген уже будет повреждён или разрушен.
Синтез белка
Синтез белков это ключевое таинство всей физиологии человека. Именно белки запускают и контролируют все процессы в организме на клеточном уровне. Если полностью изучить, какие гены и группы генов в каких случаях запускают синтез белков, и сами эти белки, то наука научиться полностью настраивать и перенастраивать весь человеческих организм.
На сегодняшний день нам известно, что реагируя на различные раздражители, в двойной спирали дезоксирибонуклеиновой кислоты активируются гены или участки с генами. Информация с этих участков копируется на РНК (рибонуклеиновая кислота) и уже РНК переносить информацию из ядра клетки, в котором находятся хромосомы, в саму клетку. РНК выступает своего рода глашатаем, который читает указ всем работникам. Так РНК заставляет клетку вести себя тем либо иным образом и вырабатывать различные белки.
Источник:
Что такое РНК
Если ДНК это кабинет министров, которые всем управляют и принимают все решения, то РНК это пресс-атташе. Он извещает всех о новых распоряжениях и указах, и раздаёт инструкции на местах.
РНК это рибонуклеиновая кислота, которая может копировать формы различных участков дезоксирибонуклеиновой кислоты и транспортировать их из ядра клетки в её внутриклеточное пространство.
Расшифровка ДНК
ДНК расшифровка стала возможна только благодаря открытию полимеразной цепной реакции и происходит следующим образом:
Проба, содержащая образцы дезоксирибонуклеиновой кислоты, быстро нагревается. Это необходимо, что бы двойная спираль раскрутилась и распалась на две самостоятельные нити.
К интересующему исследователей участку цепи генов прилепляется полимераза. Эта процедура происходит при немного боде низких температурах.
Полимераза активирует деление пойманного участка – так происходит синтез необходимых для изучения участков генов.
Участки пропитываются специальной краской, которая светиться при воздействии направленного пучка лазера. Так получают картину гена, которую можно изучать и расшифровывать.
Источник:
АНТИФИШКИ
Всё о политике в мире
Ссылки по теме:
Что значит «колесо сансары»?
500 человек спели песню в стиле шанти
Кто такой ханжа
Странная история Генриетты Лакс и ее «бессмертных» клеток
Как была расшифрована ДНК
Метки: ДНК человека видео днк интересно клетки фото человек
Новости партнёров
Запреты в Британской королевской семьей, которым нужно следовать беспрекословно
Канье Уэст назвал движение BLM мошенничеством и надел футболку с надписью «Жизнь белых имеет. ..
«Королеву красоты» из Крыма оштрафовали за исполнение песни «Червона калина»
Полиция усмотрела в интервью Собчак распространение фейков о госвласти
Безликий зелёный Чарли
Как не платить за обслуживание дебетовой карты, при этом получая кешбэк и процент на остаток
В Казахстане вор спрятался в холодильник, чтобы обчистить магазин, но у удачи на этот день были…
«Перед тобой помощник гендиректора Пулково!»: под Питером мадам наорала на посетителя ресторана…
Apple уволила за шутку о сиськах топ-менеджера, проработавшего в компании 22 года
Таки да: в Сети появилось фото израильского паспорта Пугачёвой
Подарки для Путина: что дарили президенту в его день рождения
Музыкант Константин Легостаев пропал без вести после купания в Сочи
«Пилят и пилят»: мэр Воркуты рассказал о причинах, по которым добровольцы идут в военкомат
Чем крут сериал «Что делать женщине, если у неё два любовника, а выбрать нужно одного»
Новости СМИ2
Взрыв цистерны, пожар, повреждение пролёта: что случилось на Крымском мосту
Показать ещё
Удиви меня!
‘+
‘
‘+
place. title+
‘
‘+
»+
‘
Можно ли сохранить все ваши цифровые фотографии в виде ДНК? | MIT News
Сейчас на Земле имеется около 10 триллионов гигабайт цифровых данных, и каждый день люди создают электронные письма, фотографии, твиты и другие цифровые файлы, которые в сумме составляют еще 2,5 миллиона гигабайт данных. Большая часть этих данных хранится в огромных объектах, известных как эксабайтные центры обработки данных (экзабайт — это 1 миллиард гигабайт), которые могут быть размером с несколько футбольных полей, а их строительство и обслуживание обходятся примерно в 1 миллиард долларов.
Многие ученые считают, что альтернативное решение лежит в молекуле, содержащей нашу генетическую информацию: ДНК, которая эволюционировала для хранения огромных объемов информации с очень высокой плотностью. По словам профессора биологической инженерии Массачусетского технологического института Марка Бате, кофейная кружка, полная ДНК, теоретически может хранить все данные мира.
«Нам нужны новые решения для хранения этих огромных объемов данных, которые накапливаются в мире, особенно архивных данных», — говорит Бате, который также является ассоциированным членом Института Броуда Массачусетского технологического института и Гарварда. «ДНК в тысячу раз плотнее, чем даже флэш-память, и еще одно интересное свойство заключается в том, что после создания полимера ДНК он не потребляет никакой энергии. Вы можете написать ДНК, а затем сохранить ее навсегда».
Ученые уже продемонстрировали, что могут кодировать изображения и страницы текста в виде ДНК. Однако также потребуется простой способ выбрать нужный файл из смеси множества фрагментов ДНК. Бате и его коллеги продемонстрировали один из способов сделать это, инкапсулировав каждый файл данных в 6-микрометровую частицу кремнезема, которая помечена короткими последовательностями ДНК, раскрывающими содержимое.
Используя этот подход, исследователи продемонстрировали, что они могут точно извлекать отдельные изображения, хранящиеся в виде последовательностей ДНК, из набора из 20 изображений. Учитывая количество возможных меток, которые можно использовать, этот подход можно масштабировать до 10 9 .0011 20 файлов.
Бате — старший автор исследования, опубликованного сегодня в журнале Nature Materials . Ведущими авторами статьи являются старший постдоктор Массачусетского технологического института Джеймс Банал, бывший научный сотрудник Массачусетского технологического института Тайсон Шеперд и аспирант Массачусетского технологического института Джозеф Берлеант.
Стабильное хранилище
Цифровые системы хранения данных кодируют текст, фотографии или любую другую информацию в виде последовательности нулей и единиц. Та же самая информация может быть закодирована в ДНК с помощью четырех нуклеотидов, составляющих генетический код: A, T, G и C. Например, G и C могут использоваться для обозначения 0, а A и T представляют 1.
ДНК имеет несколько других особенностей, которые делают ее желательной в качестве носителя для хранения: она чрезвычайно стабильна, и ее довольно легко (но дорого) синтезировать и секвенировать. Кроме того, из-за его высокой плотности — каждый нуклеотид, эквивалентный двум битам, составляет около 1 кубического нанометра — экзабайт данных, хранящихся в виде ДНК, может поместиться на ладони.
Одним из препятствий для такого типа хранения данных является стоимость синтеза такого большого количества ДНК. В настоящее время запись одного петабайта данных (1 миллиона гигабайт) будет стоить 1 триллион долларов. Чтобы конкурировать с магнитной лентой, которая часто используется для хранения архивных данных, по оценке Бате, стоимость синтеза ДНК должна снизиться примерно на шесть порядков. Бате говорит, что ожидает, что это произойдет в течение десяти или двух лет, подобно тому, как стоимость хранения информации на флэш-накопителях резко снизилась за последние пару десятилетий.
Помимо стоимости, другим серьезным узким местом в использовании ДНК для хранения данных является сложность выбора нужного файла из всех остальных.
«Если предположить, что технологии записи ДНК дойдут до точки, когда будет рентабельно записывать экзабайты или зеттабайты данных в ДНК, что тогда? У вас будет куча ДНК, которая представляет собой миллион файлов, изображений, фильмов и прочего, и вам нужно найти одну картинку или фильм, который вы ищете», — говорит Бате. «Это как пытаться найти иголку в стоге сена».
В настоящее время файлы ДНК обычно извлекаются с помощью ПЦР (полимеразной цепной реакции). Каждый файл данных ДНК включает последовательность, которая связывается с определенным праймером для ПЦР. Чтобы извлечь определенный файл, этот праймер добавляется к образцу, чтобы найти и амплифицировать нужную последовательность. Однако одним из недостатков этого подхода является то, что между праймером и нецелевыми последовательностями ДНК могут возникать перекрестные помехи, что приводит к извлечению нежелательных файлов. Кроме того, процесс извлечения ПЦР требует ферментов и в конечном итоге потребляет большую часть ДНК, которая была в пуле.
«Вы словно сжигаете стог сена, чтобы найти иголку, потому что все остальные ДНК не амплифицируются, и вы просто выбрасываете их», — говорит Бате.
Извлечение файлов
В качестве альтернативного подхода команда Массачусетского технологического института разработала новую технику поиска, которая включает инкапсуляцию каждого файла ДНК в маленькую частицу кремнезема. Каждая капсула помечена одноцепочечными «штрих-кодами» ДНК, которые соответствуют содержимому файла. Чтобы экономически эффективно продемонстрировать этот подход, исследователи закодировали 20 различных изображений в фрагменты ДНК длиной около 3000 нуклеотидов, что эквивалентно примерно 100 байтам. (Они также показали, что капсулы могут вместить файлы ДНК размером до гигабайта.)
Каждый файл был помечен штрих-кодами, соответствующими таким меткам, как «кошка» или «самолет». Когда исследователи хотят получить конкретное изображение, они удаляют образец ДНК и добавляют праймеры, соответствующие искомым меткам — например, «кошка», «апельсин» и «дикий» для изображения. тигра, или «кошки», «апельсина» и «домашнего» для домашней кошки.
Праймеры помечены флуоресцентными или магнитными частицами, что облегчает извлечение и идентификацию любых совпадений в образце. Это позволяет удалить нужный файл, оставив остальную часть ДНК нетронутой, чтобы вернуть ее в хранилище. Процесс их поиска допускает операторы логической логики, такие как «президент И 18 -й -й век», чтобы в результате сгенерировать Джорджа Вашингтона, аналогично тому, что получается при поиске изображений в Google.
«В текущем состоянии нашей проверки концепции мы находимся на скорости поиска 1 килобайт в секунду. Скорость поиска в нашей файловой системе определяется размером данных на капсулу, который в настоящее время ограничен непомерно высокой стоимостью записи даже 100 мегабайт данных о ДНК, а также количеством сортировщиков, которые мы можем использовать параллельно. Если синтез ДНК станет достаточно дешевым, мы сможем максимизировать размер данных, которые мы можем хранить в файле с нашим подходом», — говорит Банал.
Для своих штрих-кодов исследователи использовали одноцепочечные последовательности ДНК из библиотеки из 100 000 последовательностей , каждая длиной около 25 нуклеотидов, разработанной Стивеном Элледжем, профессором генетики и медицины Гарвардской медицинской школы. Если вы поместите две такие метки на каждый файл, вы сможете уникально пометить 10 10 (10 миллиардов) разных файлов, а с четырьмя метками на каждом вы сможете уникально пометить 10 20 файлов.
Джордж Черч, профессор генетики Гарвардской медицинской школы, описывает этот метод как «гигантский скачок в области управления знаниями и поисковых технологий».
«Быстрый прогресс в записи, копировании, чтении и низкоэнергетическом хранении архивных данных в форме ДНК оставил плохо изученными возможности точного извлечения файлов данных из огромных (10 21 байт, дзетта-шкала) баз данных». — говорит Черч, не участвовавший в исследовании. «Новое исследование эффективно решает эту проблему, используя полностью независимый внешний слой ДНК и используя различные свойства ДНК (гибридизация, а не секвенирование), и, кроме того, используя существующие инструменты и химические процессы».
Bathe предполагает, что такой вид инкапсуляции ДНК может быть полезен для хранения «холодных» данных, то есть данных, которые хранятся в архиве и редко используются. Его лаборатория запускает стартап Cache DNA, который в настоящее время разрабатывает технологию долгосрочного хранения ДНК, как для хранения данных ДНК в долгосрочной перспективе, так и для клинических и других ранее существовавших образцов ДНК в ближайшей перспективе.
«Хотя может пройти некоторое время, прежде чем ДНК станет жизнеспособной в качестве носителя данных, сегодня уже существует насущная потребность в недорогих массивных решениях для хранения ранее существовавших образцов ДНК и РНК от Covid-19.тестирование, секвенирование генома человека и другие области геномики», — говорит Бате.
Исследование финансировалось Управлением военно-морских исследований, Национальным научным фондом и Исследовательским управлением армии США.
Поделиться этой новостной статьей:
Бумага
Документ: «ДНК-память с произвольным доступом с использованием логического поиска в системе хранения архивных файлов»
Упоминания в прессе
United Press International (UPI)
Репортер UPI Брукс Хейс пишет, что исследователи Массачусетского технологического института разработали новый метод маркировки и извлечения файлов ДНК, «прорыв, который может помочь уменьшить углеродный след быстро расширяющегося цифрового мира».
Полный материал через United Press International (UPI) →
Ссылки по теме
- Лаборатория Bathe
- Департамент биологической инженерии
- Инженерная школа
- Институт Броуда
Самая персонализированная и уникальная форма искусства в мире.
Легко. Безболезненно. Простой.
ДНК Портреты — самая уникальная и персонализированная форма искусства в мире. Мы вышлем вам набор для сбора образцов со всем необходимым для получения образца вашей ДНК. (Поверьте нам, это безболезненно и без усилий: не более чем мазок
внутри вашей щеки.) Сложная часть — выбрать стиль, цвет, размер и оправу из почти безграничного диапазона возможностей. Возьмите все время, которое вам нужно. Ваш личный отпечаток ДНК будет таким же уникальным, как и вы сами. Нет двух
отпечатки всегда будут одинаковыми.
Поделиться
100
твит
100
Приколи это
100
Тонны цветов.
Полностью уникальный.
Хочу увидеть больше? Посмотрите нашу галерею продуктов.
Как это работает
1
Разместите заказ
Выберите свой размер, варианты обрамления
и многое другое.
2
Мы вышлем вам набор для сбора ДНК
В комплекте с мазком из щеки, карточкой для сбора ДНК и инструкциями менее чем за 7 дней.
3
Выберите свои цвета
Используйте образцы цветов из вашего набора или мы поможем вам создать любую цветовую комбинацию.
4
Почтовый образец обратно.
Готово!
Как только мы получим ваш образец, мы обработаем вашу ДНК в нашей защищенной лаборатории, а затем создадим ваше уникальное произведение искусства! *
*На создание портрета ДНК уходит до 4 недель с момента получения нами вашего образца. Вы можете получить свой набор (также мы рекомендуем подарить его) через 7 дней.
Идеальный подарок.
Когда вы заказываете ДНК-портрет, мы отправляем вам (или вашему получателю) тонкую металлическую подарочную коробку на петлях. Набор, завернутый в характерный рукав, включает в себя все, что вам нужно для начала работы — простой в использовании набор для сбора мазков из щек,
инструкции и образцы цветов. Наши образцы цветов позволяют персонализировать ваше искусство, используя практически любую цветовую комбинацию, какую только можно вообразить! Для максимальной гибкости вы также можете
заказать подарочные сертификаты
Набор для сбора может быть отправлен в течение 7 дней.
Комплект Your DNA Portrait поставляется в элегантной металлической подарочной коробке.
В комплект входят простые инструкции.
Это так же просто, как взять мазок со щеки. Без крови!
Широкий выбор цветов.
Набор DNA Portrait Kit
Набор DNA Portrait Kit включает в себя набор мазков со щек, простые инструкции, образцы цветов для выбора цвета и конверт для отправки обратно образцов. Все внутри элегантного металлического подарка
коробка.
Параметры, Параметры и Дополнительные параметры.
Цвета для любого декора
- Инфракрасный
- Файрски
- Цитрон
- Глубокий
- Черный лед
- Северное сияние
- Ситилайты
- Лед
- Положительный
- Красный свет
- Атомный
- Ледник
- Водный
- Сумерки
- Страсть
- Сахарная вата
Автоматическая диагностика ДНК для одномерных изображений гель-электрофореза с использованием технологии обработки биоизображений
. 2015;16 Приложение 12(Приложение 12):S15.
дои: 10.1186/1471-2164-16-S12-S15.
Epub 2015 9 декабря.
Апихарт Интарапанич, Саовалук Кевкамнерд, Филип Дж. Шоу, Киттипат Укосакит, Сомвонг Трагунрунг, Сиссадес Тонгсима
PMID:
26681167
PMCID:
PMC4682448
DOI:
10.1186/1471-2164-16-С12-С15
Бесплатная статья ЧВК
Апихарт Интарапанич и др.
Геномика BMC.
2015.
Бесплатная статья ЧВК
. 2015;16 Приложение 12(Приложение 12):S15.
дои: 10.1186/1471-2164-16-S12-S15.
Epub 2015 9 декабря.
Авторы
Апихарт Интарапанич, Саовалук Кевкамнерд, Филип Дж. Шоу, Киттипат Укосакит, Сомвонг Трагунрунг, Сиссадес Тонгсима
PMID:
26681167
PMCID:
PMC4682448
DOI:
10.1186/1471-2164-16-С12-С15
Абстрактный
Фон:
Гель-электрофорез ДНК — это метод молекулярной биологии для разделения фрагментов ДНК разного размера. Применение гель-электрофореза ДНК включает снятие отпечатков пальцев ДНК (генетическая диагностика), оценку размера ДНК и разделение ДНК для Саузерн-блоттинга. Точная интерпретация образцов полос ДНК из электрофоретических изображений может быть трудоемкой и подверженной ошибкам, когда большое количество полос исследуется вручную. Хотя было предложено множество методов биовизуализации, ни один из них не может полностью автоматизировать типирование ДНК из-за сложности обычно получаемых моделей миграции.
Полученные результаты:
Мы разработали инструмент для обработки изображений, который автоматически определяет генотипы по изображениям ДНК, полученным электрофорезом в геле. Рабочий процесс обработки изображений состоит из трех основных этапов: 1) сегментация дорожек, 2) выделение полос ДНК и 3) классификация генотипирования полос. Первоначально этот инструмент предназначался для проведения крупномасштабного анализа генотипа сортов сахарного тростника. Мы протестировали предлагаемый инструмент на 10 изображениях геля (433 сорта), полученных в результате электрофореза в полиакриламидном геле (PAGE) ампликонов ПЦР для обнаружения полиморфизма длины интрона (ILP) в одном локусе сахарного тростника. Эти изображения геля продемонстрировали множество проблем с автоматической сегментацией дорожек/полос при обработке изображений, включая искажение дорожек, деформацию полос, высокий уровень шума на заднем плане и полосы, расположенные очень близко друг к другу (дуплеты). Используя предлагаемый рабочий процесс биовизуализации, дорожки и полосы ДНК, содержащиеся внутри, правильно сегментируются, даже для соседних полос с аберрантной миграцией, которые нельзя разделить обычными методами. Программное обеспечение под названием GELect автоматически выполняет вызов генотипа на каждой дорожке путем сравнения с эталоном для всех полос, который был создан путем кластеризации существующих полос в неизбыточный набор эталонных полос. Результаты автоматического определения генотипа были проверены молекулярными биологами путем независимого ручного типирования.
Выводы:
В этой работе представлен автоматизированный инструмент генотипирования на основе изображений гель-электрофореза ДНК под названием GELect, написанный на Java и доступный через платформу imageJ. Благодаря новому автоматизированному рабочему процессу обработки изображений инструмент может точно сегментировать полосы из гелевой матрицы, интеллектуально извлекать искаженные и даже двойные полосы, которые трудно идентифицировать с помощью существующих инструментов обработки изображений. Следовательно, генотипирование с помощью электрофореза ДНК в геле может выполняться автоматически, что позволяет пользователям эффективно проводить крупномасштабное снятие отпечатков пальцев ДНК с помощью электрофореза ДНК в геле. Программное обеспечение находится в свободном доступе на http://www.biotec.or.th/gi/tools/gelect.
Цифры
Рисунок 1
Искажение при гель-электрофорезе . …
Рисунок 1
Искажение при гель-электрофорезе . Образец изображения гель-электрофореза показывает общие…
фигура 1
Искажение при гель-электрофорезе . Образец изображения, полученного с помощью гель-электрофореза, выявляет общие проблемы при обработке изображений, включая геометрическое искажение, изгиб дорожки, низкоконтрастную область и артефакты из-за загрязнения образца.
Рисунок 2
Обзор GElect .…
Рисунок 2
Обзор GElect . Рабочий процесс GElect состоит из трех основных процедур: 1) полоса…
фигура 2
Обзор GElect . Рабочий процесс GElect состоит из трех основных процедур: 1) сегментация дорожек, 2) выделение полосы ДНК и 3) генотипирование полосы.
Рисунок 3
Гелевое изображение для обрезки . В…
Рисунок 3
Гелевое изображение для обрезки . Интересующая область должна быть обрезана пользователями…
Рисунок 3
Обрезка гелевого изображения . Интересующая область должна быть обрезана пользователями для анализа с помощью GElect.
Рисунок 4
Совокупная гистограмма интенсивности пикселей до…
Рисунок 4
Совокупная гистограмма интенсивности пикселей до сглаживания . Каждая точка получается суммированием…
Рисунок 4
Накопленная гистограмма интенсивности пикселей до сглаживания . Каждая точка получается путем суммирования значений интенсивности всех пикселей вдоль вертикальной линии приведенного выше изображения геля.
Рисунок 5
Сглаженная кумулятивная гистограмма интенсивности пикселей…
Рисунок 5
Сглаженная гистограмма совокупной интенсивности пикселей . После применения сглаживающего фильтра (усредненный сигнал…
Рисунок 5
Сглаженная гистограмма совокупной интенсивности пикселей . После применения сглаженного фильтра (средняя интенсивность сигнала трех смежных совокупных значений интенсивности пикселей) пики и впадины, разграничивающие нижележащие полосы, становятся более заметными.
Рисунок 6
Стек совокупных пикселей…
Рисунок 6
Набор гистограмм накопленной интенсивности пикселей . Гистограммы от разных H i…
Рисунок 6
Набор гистограмм накопленной интенсивности пикселей . Гистограммы от разных H i построены вместе на одних и тех же осях. Долины из разных полос (набор гистограмм) должны быть соединены с использованием эвристики кратчайшего пути (см. рис. S3 о том, как рисуются границы дорожек).
Рисунок 7
Взаимная корреляция между столбцами…
Рисунок 7
Взаимная корреляция между индексами столбцов для каждой дорожки . Чтобы исправить…
Рисунок 7
Взаимная корреляция между индексами столбцов для каждой дорожки . Чтобы скорректировать искажение полос внутри полосы, например, улыбку, алгоритм GELect вычисляет корреляцию интенсивностей пикселей по полосе. Смещение пикселя для каждого столбца шириной в один пиксель может быть обнаружено и скорректировано. На показанном в качестве примера графике полоса шириной 15 пикселей содержит полосы с хмурым узором. Можно видеть, что пиковые значения корреляции, построенные как парные корреляции, смещаются вдоль вертикальной оси дорожки (см. вставку).
Рисунок 8
Коррекция дисторсии . В…
Рисунок 8
Коррекция дисторсии . Левое изображение представляет собой полосу интереса, которая…
Рисунок 8
Коррекция дисторсии . Левое изображение представляет интересующую полосу, которая была проанализирована, как показано на рисунке 7. Полоса после коррекции алгоритмом показана справа.
Рисунок 9
Обнаружение полос на полосе…
Рисунок 9
Обнаружение полос на полосе . (A) Изображение переулка с…
Рисунок 9
Обнаружение полос на полосе . (A) Изображение полосы с тремя полосами, две из которых мигрировали в виде дублетов, и некоторыми незначительными артефактами. (B) Синяя кривая представляет собой суммарную интенсивность пикселей дорожки, а зеленые стебли — возможные местоположения полос, обнаруженные как производные первого порядка. (C) Три зеленых стебля являются подлинными местоположениями полос, которые превышают фоновый порог (красная линия).
Рисунок 10
Изображение межполосного выравнивания .…
Рисунок 10
Изображение межполосного выравнивания . Верхнее изображение (A) — исходное изображение…
Рисунок 10
Изображение межполосного выравнивания . Верхнее изображение (A) — исходное изображение с искажением выравнивания, а нижнее изображение — совмещенное изображение (B). Эталонная полоса в каждой дорожке, используемая для выравнивания, указана стрелкой.
Рисунок 11
Расположение всех…
Рисунок 11
Расположение всех полос . На графике показана гистограмма…
Рисунок 11
Расположение всех дорожек . На графике показана гистограмма частот полос на нескольких дорожках одного и того же геля. Расположение смещения ( x осей) — подвижность полосы относительно эталона после выравнивания дорожки. Эталонная полоса отмечена стрелкой, и ей присвоено положение с нулевым смещением. Центроиды кластеров полос, принадлежащих к обычным видам ДНК, среди дорожек, идентифицированных с помощью DBSCAN, обозначены красными кружками.
См. это изображение и информацию об авторских правах в PMC
Похожие статьи
Автоматическое картирование полос на изображениях электрофоретического геля с использованием фоновой информации.
Зерр Т., Хеникофф С.
Зерр Т. и др.
Нуклеиновые Кислоты Res. 2005 г. , 13 мая; 33(9):2806-12. doi: 10.1093/nar/gki580. Печать 2005 года.
Нуклеиновые Кислоты Res. 2005.PMID: 15894797
Бесплатная статья ЧВК.Усовершенствованная система анализа изображений одномерного гель-электрофореза.
Лабиед Ю., Каабуч Н., Шульц Р.Р., Сингх Б.Б., Милавец Б.
Лабиед Ю. и др.
Adv Exp Med Biol. 2010;680:609-17. дои: 10.1007/978-1-4419-5913-3_67.
Adv Exp Med Biol. 2010.PMID: 20865546
PyElph — программный инструмент для анализа изображений геля и филогенетики.
Павел А.Б., Василе К.И.
Павел А.Б. и др.
Биоинформатика BMC. 2012 13 января; 13:9. дои: 10.1186/1471-2105-13-9.
Биоинформатика BMC. 2012.PMID: 22244131
Бесплатная статья ЧВК.Разделение большой ДНК с использованием электрофореза в агаровом геле с чередованием полей.
Докинз Х.Дж.
Докинз Х.Дж.
J Хроматогр. 1989 11 августа; 492: 615-39. doi: 10.1016/s0378-4347(00)84481-3.
J Хроматогр. 1989.PMID: 2671005
Обзор.
Двумерное типирование ДНК: экономичный способ анализа сложных смесей фрагментов ДНК на наличие вариаций последовательности.
Видж Дж.
Видж Дж.
Мол Биотехнолог. 1995 декабрь; 4 (3): 275-95. дои: 10.1007/BF02779021.
Мол Биотехнолог. 1995.PMID: 8680934
Обзор.
Посмотреть все похожие статьи
Цитируется
К автоматическому инструменту для обнаружения олигоклональных полос в спинномозговой жидкости и слезах для диагностики рассеянного склероза: сегментация дорожек на основе одномерного открытого активного контура ленты.
Хаддад Ф., Буде С., Пейроди Л., Ванденбрук Н., Откер П., Форзи Г.
Хаддад Ф. и др.
Med Biol Eng Comput. 2020 май; 58 (5): 967-976. doi: 10.1007/s11517-020-02141-9. Epub 2020 24 февраля.
Med Biol Eng Comput. 2020.PMID: 32095981
Новая модель на основе ДНК для арифметики конечных полей.
Хирон И., Сото С., Марин С., Акоста М., Сото И.
Хирон И. и др.
Гелион. 201911 декабря; 5(12):e02901. doi: 10.1016/j.heliyon.2019.e02901. Электронная коллекция 2019 декабрь.
Гелион. 2019.PMID: 31890936
Бесплатная статья ЧВК.Усовершенствованное генотипирование отпечатков ДНК на основе модели, разработанной на основе данных электрофореза реальных чипов.
Скуткова Х., Витек М., Бездичек М. , Брхелова Е., Ленгерова М.
Скуткова Х. и др.
J Adv Res. 2019 25 января; 18: 9-18. doi: 10.1016/j.jare.2019.01.005. электронная коллекция 2019июл.
J Adv Res. 2019.PMID: 30788173
Бесплатная статья ЧВК.GIW и InCoB, две главные конференции по биоинформатике в Азии с общей 40-летней историей.
Шенбах С., Хортон П., Ю С.М., Тан Т.В., Ранганатан С.
Шенбах С. и соавт.
Геномика BMC. 2015;16 Приложение 12(Приложение 12):I1. дои: 10.1186/1471-2164-16-S12-I1. Epub 2015 9 декабря.
Геномика BMC. 2015.PMID: 26679412
Бесплатная статья ЧВК.
использованная литература
Хайдкамп WH. Электрофорез-введение, кафедра биологии, Колледж Густава Адольфа. http://homepages.gac.edu/~cellab/chpts/chpt4/intro4.html http://homepages. gac.edu/~cellab/chpts/chpt4/intro4.html
День INM, Хамфрис, ЮВ. Электрофорез для генотипирования: микротитровальный массив, электрофорез в диагональном геле на горизонтальных полиакриламидных гелях, Hydrolink или агарозе. Аналитическая биохимия. 1994;222:389–395.
—
пабмед
Браун ТА. Саузерн-блоттинг и связанные с ним методы обнаружения ДНК. Энциклопедия наук о жизни. 2001. С. 1–6.
Рио Д.К., Арес М., Хэннон Г.Дж., Нильсен Т.В. Очистка РНК с использованием TRIzol (реагент TRI) по протоколам Cold Spring Harbour; 2010.