Научные интернет порталы: Научные порталы в Интернете. Тематические сайты по научной тематике

Научные порталы в Интернете. Тематические сайты по научной тематике

Список научных ресурсов открытого доступа

• Главная
• Аспирантам
• Список научных ресурсов открытого доступа

Список научных ресурсов открытого доступа:

1. База полнотекстовых статей Science Direct. Принадлежит издательству Elsevier. Содержит 2500 научных журналов и 26 000 электронных книг. Краткое содержание большинства публикаций доступно бесплатно.
   http://www.sciencedirect.com/
2. Google Scholar — бесплатная поисковая система по полным текстам научных публикаций всех форматов и дисциплин. 
   https://scholar.google.ru/
3. EndNote— коммерческая система управления библиографической информацией, применяемая для управления ссылками и библиографией, позволяющая отформатировать их согласно многочисленным стандартам цитирования. Компания-производитель — Thomson Reuters.
   http://endnote.com/
   http://www.myendnoteweb.com/
4. Архив научных журналов Neicon — полнотекстовая база данных научных журналов.
   http://archive.neicon.ru/xmlui/
5. DOAJ это директория, предлагающая свободный (бесплатный) доступ к свыше 1500 научных и академических журналов в электронном формате по всем направлениям.
   https://doaj.org/
6. Архив открытого доступа Санкт-Петербургского государственного университета- Институциональный репозиторий СПбГУ обеспечивает хранение и распространение цифровых материалов, являющихся интеллектуальной собственностью СПбГУ. Он создан для продвижения результатов научных исследований СПбГУ и их поиск в сети Интернет. Репозиторий содержит документы и публикации, авторами или соавторами которых являются сотрудники и обучающиеся СПбГУ.
   https://dspace.spbu.ru/
7. Mendeley — бесплатная программа для управления библиографической информацией, позволяющая хранить и просматривать исследовательские труды в формате PDF, а также имеющая подключение к международной социальной сети учёных.
   https://www.mendeley.com/

Образовательные ресурсы открытого доступа:

1. TED – Technology Entertainment Design — это  проект, посвященный «Идеям, Достойным Распространения» (Ideas Worth Spreading). Проект проводится в формате научных конференций, лекции которых записаны в формате видео, доступных к просмотру на канале YouTube и официальной странице проекта.
   https://www.ted.com/talks?language=ru
2. «ИНТУИТ» — Национальный Открытый Университет. организация, предоставляющая с помощью собственного сайта услуги дистанционного обучения по нескольким образовательным программам, многие из которых касаются информационных технологий. Сайт содержит несколько сотен открытых образовательных курсов, по прохождении которых можно бесплатно получить электронный сертификат. Также возможно платное получение сертификатов о повышении квалификации. Кроме того, организация действует как издательство, выпуская учебную литературу по курсам.
   http://www.intuit.ru/
3. Coursera — проект в сфере массового онлайн-образования, основанный профессорами информатики Стэнфордского университета Эндрю Ыном и Дафной Коллер. В его рамках существует проект по публикации образовательных материалов в интернете в виде набора бесплатных онлайн-курсов. В проекте представлены курсы по физике, инженерным дисциплинам, гуманитарным наукам и искусству, медицине, биологии, математике, информатике, экономике и бизнесу. Продолжительность курсов примерно от шести до десяти недель, с 1—2 часами видеолекций в неделю, курсы содержат задания, еженедельные упражнения и иногда заключительный проект или экзамен.
   https://ru.coursera.org/

По вопросам пользования ресурсами обращайтесь к Ольге Егоровой:
E-mail:
[email protected]

и лично в A-349 c 10.00 -17.00.

Презентационные материалы семинаров по работе с электронными научными ресурсами:
Обзор и руководство пользования основными научными электронными ресурсами
Ресурсы, содержащие полнотекстовые статьи открытого доступа

Сеть, эксперты по данным разрабатывают лучший портал для научных открытий

Science DMZ включает в себя несколько DTN, обеспечивающих высокоскоростную передачу данных между сетью и хранилищем. Функции портала выполняются на сервере портала, расположенном в корпоративной сети учреждения. DTN должны говорить только с API службы управления данными (в данном случае Globus). Предоставлено: Эли Дарт, ESnet.

В наши дни легко упустить из виду тот факт, что Всемирная паутина была создана почти 30 лет назад в первую очередь для того, чтобы помочь исследователям получать доступ к научным данным и обмениваться ими. За прошедшие годы Интернет превратился в инструмент, который помогает нам есть, делать покупки, путешествовать, смотреть фильмы и даже следить за своими домами.

Между тем, научные инструменты стали гораздо более мощными, генерируя массивные наборы данных, и расширилось международное сотрудничество. В эту новую эру Интернет стал неотъемлемой частью научного процесса, но наиболее распространенный метод обмена исследовательскими данными остается прочно закрепленным. к самым ранним дням Интернета. Это может стать огромным препятствием для научных открытий.

Вот почему группа экспертов по сетям из Сети энергетических наук Министерства энергетики (ESnet) вместе с командой Globus из Чикагского университета и Аргоннской национальной лаборатории разработали новый подход, который делает обмен данными более быстрым, надежным и более безопасный. В статье, опубликованной 15 января в Peer J Comp Sci , команда описывает свой «Портал данных современных исследований: шаблон проектирования для сетевой науки, интенсивно работающей с данными».

«Размер наборов данных и количество объектов данных резко возросло, но типичный дизайн портала данных на самом деле не изменился», — сказал соавтор Эли Дарт, сетевой инженер из Сети энергетических наук Министерства энергетики. или ESnet. «Наш новый дизайн сохраняет эту простоту использования, но легко масштабируется для обработки огромных объемов данных, связанных с современной наукой».

Порталы данных, иногда называемые научными шлюзами, представляют собой веб-интерфейсы для доступа к системам хранения данных и вычислительным системам, позволяющие авторизованным пользователям получать доступ к данным и выполнять совместные вычисления. По мере того, как наука становится все более управляемой данными и совместной, порталы данных продвигают исследования в области материалов, физики, астрофизики, космологии, науки о климате и других областях.

«Устаревший» портал управляется веб-сервером, который подключен к системе хранения и базе данных и обрабатывает запросы пользователей на данные. Несмотря на то, что 25 лет назад эту простую конструкцию было легко разработать, она все чаще становится препятствием для производительности, удобства использования и безопасности.

«Проблема использования старых технологий заключается в том, что эти порталы не обеспечивают быстрого доступа к данным и не очень гибки», — сказал ведущий автор Ян Фостер, профессор Артура Холли Комптона в Чикагском университете. Директор отдела науки о данных и обучения Аргоннской национальной лаборатории. «Поскольку каждый портал разрабатывается как отдельный бункер, организация должна внедрять, а затем управлять и поддерживать несколько полных стеков программного обеспечения для поддержки каждого портала».

Новый дизайн портала основан на двух подходах, разработанных для упрощения и ускорения передачи больших наборов данных.

• Science DMZ, разработанный Dart, представляет собой высокопроизводительную сетевую конструкцию, которая соединяет крупномасштабные серверы данных напрямую с высокоскоростными сетями и все чаще используется исследовательскими институтами для более эффективного управления передачей данных.
• Globus — это облачная служба, которой разработчики порталов данных и других научных служб могут передать ответственность за сложные задачи, такие как аутентификация, авторизация, перемещение и обмен данными. Globus можно использовать, в частности, для управления передачей данных в демилитаризованную зону Science и из нее.

Кайл Чард, Фостер, Дэвид Шиффет, Стивен Туке и Джейсон Уильямс являются соавторами статьи и помогали разрабатывать Globus в Аргоннской национальной лаборатории и Чикагском университете. В своей статье авторы отмечают, что эта концепция стала возможной в 2015 году, когда Globus и Science DMZ стали зрелыми технологиями.

«Вместе Globus и Science DMZ дают исследователям мощный набор инструментов для проведения исследований», — сказал Дарт.

Одним из порталов с новым дизайном является Архив данных исследований, управляемый Национальным центром атмосферных исследований, который содержит большую и разнообразную коллекцию метеорологических и океанографических наблюдений, выходных данных операционных моделей и моделей повторного анализа, а также наборы данных дистанционного зондирования для поддержки атмосферных и геолого-геофизических исследований. исследовательская работа.

Например, ученый, работающий в университете, может загрузить данные из Национального центра атмосферных исследований (NCAR) в Колорадо, а затем использовать их для моделирования в суперкомпьютерных центрах DOE и NSF в Калифорнии и Иллинойсе и, наконец, передать данные в ее родное учреждение для анализа. Чтобы проиллюстрировать, как работает схема, Дарт выбрал 460-гигабайтный набор данных в NCAR, инициировал передачу Globus в Национальный научно-вычислительный центр энергетических исследований Министерства энергетики в Национальной лаборатории Лоуренса в Беркли, вошел в свою учетную запись хранилища и начал передачу. Четыре минуты спустя 5141 файл был без проблем передан.

Как работает дизайн

Портал данных современных исследований использует модель традиционного портала с одним сервером и разделяет ее на три отдельных компонента.

• Веб-сервер портала выполняет поиск и доступ к указанным данным, а также аналогичные задачи.
• Серверы данных, часто называемые узлами передачи данных, подключены к высокоскоростным сетям через специализированный анклав, в данном случае Science DMZ. Science DMZ обеспечивает выделенную безопасную связь с серверами данных, но позволяет избежать общих узких мест в производительности, вызванных типичными конструкциями, не оптимизированными для высокоскоростной передачи.
• Globus управляет аутентификацией, доступом к данным и передачей данных. Globus позволяет пользователям управлять данными независимо от местоположения или системы хранения, в которой находятся данные, и поддерживает передачу, совместное использование и публикацию данных непосредственно из этих систем хранения.

«Шаблон проектирования, таким образом, определяет отдельные роли для веб-сервера, который управляет тем, кому и что разрешено делать; серверов данных, где с данными выполняются авторизованные операции; и внешних служб, которые организуют доступ к данным», — пишут авторы.

Globus уже используется десятками тысяч исследователей по всему миру с конечными точками в более чем 360 точках, поэтому многие исследователи знакомы с его возможностями и регулярно полагаются на него. На самом деле около 80 процентов крупных исследовательских университетов и национальных лабораторий в США используют Globus.

В то же время более 100 исследовательских университетов по всей стране развернули научные демилитаризованные зоны благодаря финансовой поддержке в рамках программы киберинфраструктуры кампуса Национального научного фонда.

Важным компонентом системы является «небольшой агент под названием Globus Connect, который очень похож на агенты Google Drive или Dropbox, которые можно установить на свои собственные ПК», — сказал Чард. Globus Connect позволяет службе Globus перемещать данные на компьютер и с него, используя высокопроизводительные протоколы, а также HTTPS для прямого доступа. Это также позволяет пользователям динамически обмениваться данными со своими коллегами.

По словам Чарда, дизайн предоставляет исследовательским организациям простые в использовании технологические инструменты, аналогичные тем, которые используются стартапами для оптимизации разработки.

«Если мы посмотрим на промышленность, начинающие компании теперь могут опираться на набор услуг, чтобы упростить то, что им нужно для создания и управления собой», — сказал Чард. «В исследовательской среде Globus разработал набор таких возможностей, которые необходимы любому исследовательскому порталу. Недавно мы (Globus) разработали интерфейсы, которые позволяют разработчикам легко использовать эти возможности в качестве платформы».

«Благодаря такому дизайну у пользователей есть платформа, которая позволяет им легко размещать и передавать данные без увеличения человеческих усилий по мере увеличения объема данных», — сказал Дарт.

Дополнительная информация:
Кайл Чард и др. Портал данных современных исследований: шаблон проектирования для сетевой науки с интенсивным использованием данных, PeerJ Computer Science (2018). DOI: 10.7717/peerj-cs.144

Предоставлено
Национальная лаборатория Лоуренса Беркли

Цитата :
Работая в сети, эксперты по данным разрабатывают лучший портал для научных открытий (2018 г., 29 января 2018 г.).)
получено 15 ноября 2022 г.
с https://phys.org/news/2018-01-networking-experts-portal-scientific-discovery.html

Этот документ защищен авторским правом. Помимо любой добросовестной сделки с целью частного изучения или исследования, никакие
часть может быть воспроизведена без письменного разрешения. Контент предоставляется только в ознакомительных целях.

AMO для всех: как онлайн-порталы демократизируют область атомной, молекулярной и оптической физики

Сейчас у AMOS Gateway около 300 зарегистрированных пользователей, он запускает коды для знающих пользователей по всему миру, а также служит образовательным инструментом для студентов, которые хотят изучить многие практические способы, которыми вычислительная AMO может помочь им в изучении атомных и молекулярных квантовых вычислений. системы ведут себя.

Что происходит, когда атомы и электроны сталкиваются друг с другом или излучаются светом, и как нам помогает знание этих ответов? Эти вопросы занимали большую часть моей научной карьеры. Ответы могут показаться не важными для многих людей за пределами области атомной, молекулярной и оптической физики (АМО), но они влияют на многие вещи, от ядерных термоядерных реакторов до обычной люминесцентной лампочки.

Возможно, вы помните из школьного курса химии, что у атомов есть электроны, вращающиеся вокруг ядра. Эти электроны могут возбуждаться светом или другими частицами, повышая их энергию до более высоких энергий или полностью отделяя их от атома, создавая ионы. Свечение люминесцентной лампы вызвано такого рода возбуждением. Оказывается, если мы сможем измерить и понять количество энергии, которое требуется, чтобы вызвать эти возбуждения в различных атомах и молекулах, мы сможем использовать эту информацию во всех видах приложений. Некоторые из них относятся к фундаментальной физике, например, определение того, как первые атомы начали формироваться после Большого взрыва. Другие практичны, например, преодоление проблем конструкции термоядерного реактора, когда высокоэнергетические ионы могут значительно ухудшить производительность реактора. Это довольно интересно, но, как я обнаружил, для детального понимания этих процессов могут потребоваться одни из самых мощных компьютеров, когда-либо изобретенных человечеством.

Я получил докторскую степень. по теоретической химии в Чикагском университете в 1968 году. Это было давно, и за прошедшие 50 с лишним лет был достигнут огромный научный прогресс. После постдока и недолгой работы в промышленности я попал в LASL — Лос-Аламосскую научную лабораторию, как она тогда называлась, сегодня называемую Лос-Аламосской национальной лабораторией. Я многому научился за несколько лет, и, учитывая, что в LASL была самая передовая вычислительная инфраструктура в мире, я воспользовался возможностью, чтобы сделать вычислительные AMO основным направлением своих исследований.

Исследователи вычислительной АМО разрабатывают математические модели того, как атомы и молекулы ведут себя при столкновении или облучении светом, и загружают эту модель (или «код») в компьютер, который затем вычисляет результаты — и все это без физического физического воздействия. эксперимент.

Сосредоточение внимания на этом казалось мне легкой задачей, так как передо мной была таблица богатства, которой мало кто обладал. Во-первых, у меня был доступ к некоторым из лучших компьютеров, доступных в то время. Я программировал на первых суперкомпьютерах Control Data Corporation 6600 и 7600, а затем на Cray-1, который поступил в LANL в 1976. У Cray-1 не было операционной системы, и прошло почти два года, прежде чем он стал полностью функционирующей и в целом производительной машиной, но какой это была машина. Он производил около 10 ⁸ флопов в секунду, имел миллион слов 64-битной памяти (намного больше, чем у 7600) и работал примерно в 10 раз быстрее, чем 7600. Компьютеры с тех пор, конечно, продвинулись вперед. Приличный высокопроизводительный вычислительный кластер сегодня может работать в 100 000 раз быстрее, чем Cray.

Компьютер Cray-1, подобный показанному здесь, был самым современным в Лос-Аламосской научной лаборатории в 1976.

Но у нас были проблемы с обменом нашей работой с остальными участниками поля. Наши коды оставались плохо документированными (у кого было время?) и, конечно же, не получили широкого распространения. В значительной степени это все еще является нормой в AMO даже сегодня, хотя это не относится ко многим другим областям теоретической физики, таким как физика элементарных частиц и гравитационная физика. Ситуация в AMO всегда беспокоила меня, так как я чувствовал, что если бы эти весьма эффективные коды были более удобными для пользователя и легкодоступными, то было бы сделано гораздо больше научных работ.

Перенесемся на 20 лет вперед, и я стал директором программы теоретического AMO в Национальном научном фонде (NSF), где я активно участвовал в программе суперкомпьютера NSF и, в конечном итоге, в проекте XSEDE (Extreme Science and Engineering Discovery Environment). . За это время я больше узнал о высокопроизводительных вычислениях, а также о научных шлюзах. Шлюз — это веб-сайт или портал, который позволяет пользователю получить доступ к этим современным кодам и использовать их на удаленных вычислительных платформах для изучения научных проблем. Я понял, что эти шлюзы, которые использовались в других областях, могут коренным образом изменить мир АМО, предоставив гораздо большему количеству ученых доступ к нашим современным кодам АМО.

У меня появился шанс воплотить свои проповеди в жизнь, когда я ушел из NSF в 2014 году, чтобы занять должность в NIST. К тому времени стало очевидно, что наша способность собирать невероятное количество данных из экспериментальных источников, вычислений и датчиков открывает огромные возможности, а также бросает вызов всем областям науки.

Однако в мире вычислительной AMO мало что изменилось. Большинство кодов все еще были доморощенными, не имели документации и имели ограниченное распространение. Это препятствовало научному прогрессу и, как ужасный побочный эффект, означало, что большинство кодов оказывались в куче программного мусора, когда студенты или постдоки, которые их разрабатывали, уходили. Это была ужасная трата человеческих ресурсов, которая часто приводила к изобретению велосипеда. Я надеялся, что смогу стать катализатором реальных культурных изменений, и семинар, который я помог организовать в Гарварде в мае 2018 года, положил начало этому процессу. Семинар привел к тому, что несколько критических групп решили объединиться и разработать шлюз AMO Sciences (AMOS), где пользователи могли бы получить доступ к множеству кодов и запускать их через веб-интерфейс на суперкомпьютерных системах NSF.

Мы сотрудничали с экспертами из Университета Индианы и смогли настроить и запустить шесть передовых кодов на том, что сейчас известно как AMOS Gateway. Теперь даже менее искушенные пользователи могут заходить в шлюз и выполнять настоящие расчеты, не зная, как загружать и создавать код, что само по себе может стать препятствием для неопытных пользователей. Результатом является демократизация сферы АМО, где грань между имущими и неимущими стирается.

В настоящее время шлюз имеет около 300 зарегистрированных пользователей, запускает коды для знающих пользователей по всему миру, а также служит образовательным инструментом для студентов, которые хотят изучить многие практические способы, которыми вычислительная АМО может помочь им в изучении атомных и молекулярных квантовых систем. вести себя.

Шлюз AMOS также оказал влияние на проблемы, занимающие центральное место в миссии NIST. NIST уже много лет предоставляет научному сообществу данные об энергетических уровнях, спектральных свойствах и сечениях рассеяния электронов на атомах и некоторых молекулах. Для многих атомных мишеней экспериментальные результаты недоступны не только из-за ограниченного числа ученых, проводящих эксперименты, но и из-за того, что многие из этих систем не могут быть легко приготовлены в лаборатории. С появлением новых и мощных компьютеров, особенно с графическими процессорами, ситуация изменилась.

Кроме того, базовая теория продвинулась до такой степени, что ряд атомных компьютерных кодов может с некоторым авторитетом утверждать, что они способны производить более надежные данные, чем многие эксперименты. Примером могут служить расчеты шлюза AMOS для атомарного индия, который является кандидатом на замену ртути в уличных фонарях, но, как известно, его трудно изучать экспериментально.